创新政策是一个“整合”概念,是国家营造创新环境、建设国家创新体系的相关政策(包括科技、财政、税收、金融、政府采购、知识产权、人才、教育政策以及与创新相关的宏观经济、贸易、投资、产业、竞争等政策)的有机结合和相互协调。以1978年全国科技大会为起点,我国已推行了4次有关创新的战略规划,取得了举世瞩目的成就。为实现2020年步入创新型国家行列的目标,我国各级政府、部门已经推出了许多的创新政策,实现这些创新政策的协同效应以及各级政府、各部门的跨界合作是面临的首要问题。从全球范围来看,美国是推行创新政策取得成功的典型国家,可以说美国经济的成功是源于其上世纪80年代实施的一系列的推动科技与经济紧密结合的创新政策。中美两国分别为单一制和联邦制的国家,两国具有不同的创新政策的跨部门协调模式,美国表现为“制衡-合作”模式,中国为“等级-线性”模式。不同的跨部门协调模式也产生了不同的创新政策结果,比较研究两者可以探索出两国的优势和劣势,可以分析出美国的相关政策和做法对中国的借鉴意义。OECD所做的《中国创新政策研究报告》指出:中国创新政策方面还存在诸多问题,其中多数的问题与中国的创新政策的跨部门协调不力,而导致的国家创新体系功能发挥不足相关;相比之下,美国却很好的实现了创新政策的跨部门协调。因此,对比研究中美两国创新政策的跨部门协调机制,学习美国的成功经验,进行本土化改造应用,对于我国实现2020年步入创新型国家行列的战略目标具有重要的借鉴、指导作用。本研究从两国国家创新体系入手,对比分析两国国家创新体系中政府、企业、高校、科研机构扮演的角色,分析出两国创新参与者在创新政策中的作用;进一步从两国跨部门协调的主要模式进行对比分析,研究两国创新参与者已形成的主要协调合作状态,比较两国主要的跨部门协调模式存在的优缺点;再从创新政策制定的层面,从内部协调和外部协调两个方面,判定两国创新政策的跨部门协调的运行现状;并以美国能源创新计划和中国2011计划为案例,从实践层面描述和分析两国的跨部门协调状况;再从R&D运行情况层面,通过建立定量分析模型,计量两国跨部门协调的协调强度和协调水平,并根据计量结果,分析出中国跨部门协调存在的问题;最后,结合美国创新政策跨部门协调机制的成功经验,从结构层面、制度层面和机制层面,提出优化中国创新政策的跨部门协调机制的意见和有益措施。