线虫MRP1和膜翅目Mhc互斥可变剪接进化动态与顺式元件的初步研究

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可变剪接是RNA转录后的一种重要加工机制,该机制广泛存在于真核生物中,是增加蛋白质多样性的重要途径。可变剪接类型多种多样,互斥可变剪接是其中的一种。互斥可变剪接的特点是只能从一个互斥外显子簇中选择有且只有一个可变外显子进入成熟mRNA,从而可以因外显子的不同选择形成不同的mRNA,进而形成不同的蛋白质。MRP1基因和Mhc基因中均存在互斥可变剪接的情况,但相关文献报道较少。MRP基因编码的多药耐药性蛋白属于先天免疫蛋白,但却是引起肿瘤细胞多药耐药性的一个重要因素。在我们的研究对象秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)中,MRP1的第13组外显子含有4个可变外显子,实验证明主要表达的是外显子Exon2和Exon3。通过比较基因组学,我们重点分析了9种线虫的同源MRP1,初步了解了线虫物种MRPl互斥可变剪接的进化动态。同时对其内含子序列进行分析,结果显示在内含子中可能存在顺式调控元件。然后应用BLAST方法从多个基因数据库中获得包括线虫在内的115种生物物种的MRP1同源基因序列并进行比较分析,结果显示MRP1基因在不同物种存在着较大的进化动态性,并具有物种特异性或种系特异性。最后我们构建线虫表达载体并对线虫活体进行显微注射,实验结果显示F2线虫表现出了不规则的运动轨迹,说明显微注射实验已经成功。这些初期研究的开展,为进一步研究MRP1的互斥剪接机制奠定了坚实的基础。Mhc基因编码的肌球蛋白重链是肌球蛋白的重要组成部分,在肌肉细胞表达中由于存在互斥可变剪接而具有不同的构型。本研究中,我们运用BLAST方法获得了膜翅目12个物种的Mhc同源基因序列,并对其进行进化动态分析,结果显示Mhc的5簇可变外显子中,第1、2、4、5簇外显子具有保守性而第3簇可变外显子则显示了较大的进化动态性。此外通过比较基因组学,我们还初步分析了Mhc内含子序列,发现在第2簇可变外显子中,存在着比较明显的保守区域,推测可能是对互斥剪接具有调控作用的顺式元件。这些实验结果可以为阐释Mhc基因互斥剪接作用机制奠定良好基础。
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