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棉花是重要的经济作物,每年因黄萎病(Verticillium wilt)的侵染导致产量损失严重,纤维品质降低。由于陆地棉中缺乏抗性种质,因此从抗病的海岛棉中挖掘抗病相关基因,通过功能鉴定可以为陆地棉抗病分子育种提供基础。本实验采用了大规模测序技术454测序平台(454-GS-FLEX Titanium)对海岛棉抗病品系‘7124’受黄萎病菌侵染后4h、12h、24h、48h的根部混合RNA进行了转录组测序。测序后获得了753934条平均读长为250bp的reads,通过去除低质量的片段后获得579532条高质量reads,利用软件拼接后获得了25237条contigs。通过与黄萎病菌的基因组CDS比对发现有10条contigs能够匹配到黄萎病菌基因组的序列；此外将拼接的contigs分别与拟南芥基因数据库、棉花unigene数据库、]NCBI非冗余蛋白数据库进行比对后发现能够匹配上的序列均达80%以上。与实验室建立的海岛棉纤维表达数据库比对后发现,有80%的454转录组序列被匹配到了纤维表达数据库中。通过转录组测序发掘了10个棉花可能编码类受体蛋白的基因。利用棉花D基因组基因信息获得了这10个棉花类受体蛋白的全长序列,并通过与拟南芥类受体蛋白、番茄及其近缘种的Vel基因或类Vel基因以及棉花中类Ve基因进行同源分析。结果显示GbRLP1、GbRLP4-1、 GbRLP4-2、GbRLP42、GbRLP47与已报道的棉花类Ve基因具有较高的同源性。对这10个类受体蛋白基因做了组织表达分析,结果显示它们在正常条件下棉花的多个组织中表达量均很低,且在各个组织中呈现表达的多样性；其中GbRLP13在棉花根部特异表达,是棉花根部特异表达的类受体蛋白基因。这10个类受体蛋白在受黄萎病菌诱导后呈现不同的表达模式,GbRLP4-1受黄萎病菌诱导上调；GbRLP1、GbRLP4-2、GbRLP15、GbRLP51-2受黄萎病菌诱导下调,受JA、SA诱导后也有不同的表达变化。现有的实验表明这些类受体蛋白可能参与了棉花抗黄萎病反应,目前正在采用病毒介导的基因沉默技术探讨这10个类受体蛋白在棉花抗黄萎病中的功能。本研究为发掘棉花根部特异或高效表达的基因,丰富现有的以纤维表达数据为主体的棉花基因数据库提供了基础。