产紫青霉β-葡萄糖醛酸苷酶及其与底物复合物的结构研究神经生长因子NGF与脂分子复合物结构与功能研究

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本论文由两部分组成。  第一部分为重组产紫青霉β-葡萄糖醛酸苷酶及其与底物复合物的晶体结构研究。来自产紫青霉的β-葡萄糖醛酸苷酶属于糖苷酶家族2,该酶对底物的特异性包括糖基和苷元的识别两部分。  目前为止,关于β-葡萄糖醛酸苷酶多集中在高效抑制剂的研究,由于没有得到β-葡萄糖醛酸苷酶与底物复合物晶体结构,其催化糖苷键水解的机理只能参照其它糖苷酶,底物特异性问题并没有得到解释。β-葡萄糖醛酸苷酶如何识和结合底物分子中的苷元部分底物特异性研究是最为关键的问题,亟待解决。研究发现,甘草酸GL在β-葡萄糖醛酸苷酶的催化作用下可以分解成单葡萄糖醛酸基甘草次酸GAMG和甘草次酸GA。因此我们可以利用GL作为研究对象,通过解析β-葡萄糖醛酸苷酶与甘草酸GL及其产物形成的复合物结构,进而揭示其催化机理。  我们解析了真菌产紫青霉β-葡萄糖醛酸苷酶及其与底物葡萄糖醛酸、GL和GAMG复合物品体结构。结合定点突变确定了其活性中心催化关键氨基酸位点,并利用饱和突变活性筛选改造该酶对GL和GAMG的底物特异性。  第二部分为神经生长因子NGF与脂分子复合物结构与功能研究。  神经生长因子NGF是一种重要的蛋白质,它能够参与细胞存活,分化,增殖等生理过程。NGF能够识别和激活两种受体传递信号,一种是高亲和力的TrkA受体,一种是低亲和力的p75受体。  之前我们实验室解析了鼠源神经生长因子mNGF与lysoPS复合物晶体结构,发现lysoPS结合在NGF双体形成的结合口袋处,并且发现NGF分子与lysoPS相互作用关键氨基酸,Lys88。另外,生化试验结果表明,lysoPS的结合与NGF对肥大细胞的组胺释放活性有关,当二者共同刺激肥大细胞时会显著提高其脱颗粒反应释放组胺的水平。为了更好地研究清楚NGF识别脂分子的结构特点,接着解析了mNGF与溶血磷脂酰肌醇LPI(13∶0 LPI)复合物晶体结构。很有意思的是,在复合物结构中发现,除了与脂分子的头部甘油和磷酸基团相互作用的关键氨基酸Lys88之外,还发现了两个新的脂分子结合关键氨基酸Tyr52和Arg50,二者是通过与脂分子的头部肌醇基团形成氢键来协助脂分子结合的。我们的结构揭示了含有肌醇基团脂分子的结合识别机制,有助于设计通过NGF运载的活性化合物。
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