Arabidopsis thaliana BTR1蛋白的原核表达及理化性质分析

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:daxia3301
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
BTR1蛋白是拟南芥中与番茄花叶病毒(ToMV)基因组RNA相结合的蛋白,能抑制此病毒的扩增。BTR1由334个氨基酸残基组成,其含有三个异构核核糖核蛋白K同源RNA结合结构域(KH domain),KH domain能有序列特异性的与单链核酸结合。BTR1基因产生两个剪接变体mRNA,分别编码不同蛋白产物BTR1L和BTR1S,拟南芥中主要表达的是BTR1S蛋白。BTR1S蛋白的mRNA在拟南芥的叶,茎及果实的组织中都可以表达。ToMV的基因组RNA长度为6384nts,并且具有71nt的5’UTR(非翻译区)和202nt的3’UTR。BTR1S优先并直接结合ToMV基因组RNA的5’UTR。BTR1的敲除和过表达分别导致拟南芥叶中ToMV增殖的增加和减少,但是在原生质体中,这种影响很难被检测到。并且这种影响是特异性的。目前为止,对于BTR1蛋白的研究报道非常少见,关于该蛋白的晶体结构及功能机制并没有报导,并且BTR1蛋白对ToMV扩散的负面影响的基础机制也是未知的。本研究对Arabidopsis thaliana BTR1基因的原核表达载体进行构建,然后进行原核表达,利用层析的方法纯化得到了BTR1蛋白,并对其均一性、聚集状态及与单链核酸的结合活性进行了分析,为进一步研究BTR1蛋白的结构和功能等提供了基本数据。主要获得以下研究结果:1.人工合成经过优化的编码序列Arabidopsis thaliana BTR1基因,构建pET-15b(BE-)SUMO-BTR1表达质粒,转化到E.coli 2566感受态中18℃诱导表达,使用Ni-NTA柱及Superdex 200进行蛋白纯化,得到了纯度大于95%的BTR1蛋白,其分子量约为34kD。2.通过凝胶过滤层析和动态激光散射技术(DLS)对BTR1蛋白的均一性及聚集状态进行了详细全面的分析。结果显示,BTR1蛋白有很好的均一性,在溶液中聚集状态可能为多聚体,而不是单体。3.通过凝胶滞缓实验(EMSA)分析BTR1蛋白与单链核酸的结合活性,结果显示BTR1具有单链DNA和RNA的结合活性,与双链DNA和G4无法结合。4.通过荧光各向异性技术进一步测定BTR1蛋白与单链核酸的结合活性,结果显示与EMSA所测定的结果相一致,BTR1能与单链DNA和RNA相结合。对于相同类型的ssDNA与ssRNA底物,随着链的增长BTR1对其结合活性呈逐渐增强的趋势。BTR1对于序列是随机的ssDNA比序列中含有连续重复碱基的ssDNA的结合活性更强。BTR1与ssRNA的结合活性要强于与ssDNA的结合活性。5.假丝酵母Pif1解旋酶(Capif1)可以在撞击端粒酶之后行使解旋酶功能,然后进行第二轮的延伸,并且发现Capif1具有3’-5’外切活性。将构建成功的重组质粒,转化到E.coli BL21(DE3)感受态中18℃诱导表达,使用Ni-NTA亲核柱、SP阳离子柱及Superdex200进行蛋白纯化,得到了纯度大于95%的Capif1蛋白,其分子量约为79kD。本研究成功构建并表达纯化了高纯度的BTR1蛋白,明晰了其均一性与聚集状态,测定了其与单链核酸结合的活性,为接下来的BTR1晶体制备及结构解析奠定了基础。纯化出纯度大于95%的Capif1蛋白,用于一系列对其活性研究的实验中。
其他文献
<正> 阴虚盗汗福清县港兜村侨眷王某妻,年三十二岁,于1949年7月中旬感染肠热病。经莆田、涵江两医院住院治疗三月零,余热不解,转为阴虚盗汗。至9月末出院回家,改延中医王某诊
<正>经过半个世纪的发展,我国急诊科建设获得了长足进步,尤其是综合医院急诊科的建设成效显著,但是仍存在一些问题。2005年中华医学会急诊医学分会向105所三级综合医院急诊科
会议
在爆炸冲击毁伤效应的研究中,钢筋混凝土结构在爆炸冲击载荷作用下的动态响应分析是其中的重要内容,也是靶场试验的重要组成部分。为了减少试验成本和降低试验风险,采用数值
<正>2008年,浙江省海宁市长街镇蛏子养殖净面积为3.06万亩,总产量1.39万吨,总产值达1.67亿元,占当地渔业总产值的48.5%。全镇仅从事蛏子捕捞、收购、贩运、加工和烹饪的就达
目的探讨尘肺病经济负担特点及其影响因素,为减轻尘肺病经济负担提供依据。方法采用回顾性流行病学调查方法,对2010—2011年尘肺病住院治疗患者和门诊治疗患者421例的一般情
近几年山西省部分地区甜樱桃建园速度较快,总体面积虽然增大了,可管理不善使得经济效益不甚理想。经过对各个地方的调查并结合生产实际和经验,总结了几个影响甜樱桃高产稳产
<正>近年来,卢氏县充分利用国家退耕还林优惠政策,大力发展核桃产业,核桃栽植面积不断扩大。目前有核桃2.8万hm2,年产核桃2.1万t,产值5.46亿元。核桃生产在全国十强县中排名
为了提高光伏发电系统的效率和稳定性,从而有力促进可再生能源的推广,提出一种应用于光伏电池系统的最大功率点跟踪控制器。首先,对光伏电池系统进行Matlab/Simulink建模和仿
装置艺术与建筑存在的共通性,使建筑可以成为一个巨大的装置作品,装置艺术对建筑的渗透,使建筑表现出观念泛化、材料异化、多感官体验和互动参与的“装置性”特点,提出了一种更为
肠黏膜有两种重要功能:吸收功能和屏障功能。多年来人们对于前一种功能的研究比较多,而对于后一种功能的认识则相对比较薄弱。众所周知,人体肠腔内有大量的细菌和多种毒素,但正常