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建立了基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)直接扫描生物组织切片获得切片中组分分布图的方法。考察了新鲜组织贮存，冰冻切片的方法；探讨了基质种类、浓度、覆盖方法，研发了基质喷雾专用装置和方法，优化了质谱信号全自动扫描参数：15mg／mL SA逐步喷雾法、15μm切片厚度、200μm点阵间距、30％～50％激光能量和200次信号累加；优化了原始信号全自动处理参数和质谱峰统计参数。自编软件补充了商用软件所缺少的“组织切片质谱平均谱以及谱峰命中次数Hits值分布统计”两个重要功能。结果表明，Hits值越大，组分分布越广。通过对照品的质谱成像分析，证实了本方法的组分分布图像的定位是准确的。本文共获得250余张切片的4万多张质谱图。该方法稳定可行，重复性优于80％。分析了SD大鼠的肺水肿组织(16例)和正常肺组织(15例)，采用t-检验(P＜0.05)筛选出12个差异分子，其中，3个上调，9个下调，而且上调、下调的分子与其分子量密切相关，这在其他组织的相关研究中未观察到，可能是肺水肿疾病特有的。根据这12个差异分子建立分类预测模型，对11个混合样例进行盲筛，准确率达到91％(10／11)。还分析了人胃肠间质瘤组织(12例)和正常组织(12例)，采用t-检验统计学方法，筛选出16个具有统计学意义的差异分子(P＜0.05)，其中，9个上调，7个下调。根据这16个差异分子建立分类预测模型，对8个混合样例进行盲筛，准确率达到100％。另外，本文还统计了肝脏、肺水肿组织、胃肠间质瘤三类组织的7000余张质谱成像图，归纳出如下图像分布规律：(1)肝脏组织：互补型、满屏型(高密度型)、中屏型(中密度型)；(2)正常肺组织：新月型、满屏型、中屏型：(3)肺水肿组织：领结型、满屏型、领结互补型；(4)正常胃肠肌层组织：满屏型、周边型、稀少型；(5)胃肠间质瘤组织：满屏型，边缘型、稀少型。这些分布规律对于进一步研究疾病的发生发展具有重要的参考意义。