红点齿蟾隶属于角蟾科齿蟾属。为了确定红点齿蟾种群的独立群数目,了解种群是否发生扩散,本研究选用线粒体基因片段和微卫星标记对红点齿蟾进行谱系地理学研究。研究样品采集于湖南、湖北、重庆、四川、贵州等地区,采集300个样本,共计20个种群。在线粒体水平上,对20个种群的300个样本线粒体DNA片段进行测序,测序位点包括ATP6和CO3基因部分序列,一共为838bp。使用Phyml软件进行单倍型建树;通过TCS软件对红点齿蟾的进行单倍型网络图分析;通过Beast软件对红点齿蟾的分歧时间进行估算;使用Dnasp和Beast软件对红点齿蟾的种群历史动态进行分析。在微卫星水平上,对20个种群中的129个红点齿蟾样本进行了分析。使用GenAlEx软件进行遗传多样性分析;通过structure软件确定红点齿蟾支系遗传结构;使用Bottleneck软件分析红点齿蟾的种群瓶颈作用情况。主要结果如下:1.线粒体基因片段具有丰富的变异位点,共监测到48个单倍型。主要分为四个支系:西部分支(第一支系:重庆南川区,贵州绥阳县,贵州遵义市金沙县,重庆武隆区),东部分支(第二支系:湖北五峰县,湖北龙山县,重庆彭水县,湖南张家界沅陵县),西南分支(第三支系:贵州黔西县,贵州六盘水市水城县,贵州瓮安县,贵州纳雍县,湖北利川县)和南部分支(第四支系:贵州施秉县,贵州务川县和贵州凤冈县)。2.BEAST分歧时间分析表明,在7.1 Mya以前,红点齿蟾形成了独立的种群,恰值第四纪冰后期气候剧烈变化。在6.4 Mya以前分化出A(第一支系构成)、B(第二~第四支系构成)两大进化枝,同年代亚洲季风气候正在逐渐加强。在4.9Mya以后,B进化枝逐步分化为现有的另外三大支系。3.中性检验中除去第二支系,其他三个支系的Fu’s Fs值和Tajima’s D值均为负值,可能存在种群扩张迹象。4.错配分析图中,四个支系均为多峰曲线,表明种群稳定且内部遗传结构复杂。也可能是由于拥有多个特有单倍型所致,因为特有单倍型容易检测出多峰。5.BSP分析表明,红点齿蟾总种群近期有扩张现象,其中第二支系有近期扩张现象,第四支系一直出现扩张现象,第一与第三支系相对来说比较稳定。6.在物种水平上,红点齿蟾种群的固定系数F值均小于0,推测种群内可能存在杂合子过剩的现象,说明红点齿蟾种群内没有近交现象,也可能种群内存在某种回避机制。7.Structure结果与ML树结果不同,认为红点齿蟾可能有两个独立群。