目的:新型农村合作医疗制度是党中央、国务院为进一步统筹全国城乡经济发展,迅速改变农村面貌,努力提高广大农村居民的健康水平进而全面实现小康社会的得力举措,其根本目的是在最大程度上减少农民“因病致贫,因病返贫”现象的发生,而在新型农村合作医疗的实施过程中,最能影响其发展的就是各试点县所确定的参合农民住院费用起付线、封顶线、以及补偿比,这些补偿方案确定的合理与否将直接影响到参合农民的受益面和受益率,因此,本研究旨在利用住院补偿的测算方法,重新调整试点县的起付线、封顶线、补偿比,进而供相关管理单位参考,为新疆新型农村合作医疗的健康和顺利发展提供理论依据。方法:采用随机整群抽样的方法,从2006年新疆北疆实施新型农村合作医疗制度的试点县中抽取A县、B县、C县、D县4个试点县,使用Excel电子表格进行数据录入,利用SPSS11.0统计软件进行统计分析,同时对不同医疗机构的医疗费用分布进行P-P散点图拟合,单样本K-S拟合优度检验,次均住院费用的估计及补偿方案的评价。结果:根据起付线、封顶线、以及补偿比的测算方法,重新调整了2006年A县、B县、C县、D县不同级别医疗机构的起付线、封顶线、补偿比,通过P-P散点图拟合和单样本K-S拟合优度检验,表明参合农民在不同级别医疗机构发生的医疗费用分布呈对数正态分布,利用次均住院费用的理论估计,计算出了参合农民在不同级别医疗机构的次均住院费用与实际的次均住院费用的均数和方差,利用医疗机构住院费用分布为对数正态分布的结果,对重新调整的起付线、封顶线进行了评价,结果表明,目前重新调整的起付线、封顶线较为合理。结论:目前新疆新型农村合作医疗制度开展基本顺利,但各试点县在起付线、封顶线以及住院补偿比的设定上比较保守,所以参合农民的受益率较低。住院补偿方案设定的稳定性不强,需要进一步的加强和改善。此外对住院费用的测算方法、住院费用分布的拟合和次均住院费用的理论估计方法的确定,以及对重新调整的补偿方案的统计学评价,进一步表明该调整方法的可行性,这种方法的确立,为新型农村合作医疗相关管理单位住院补偿方案的进一步合理制定提供了理论依据,也为新疆新型农村合作医疗的顺利发展提供了理论参考。