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炭疽菌属(Colletotrichum Cda.)是分生孢子盘具有刚毛的一类全球性分布的植物病原菌,又名刺盘孢属。该属真菌引起多种作物采收前和采收后炭疽病,每年导致大量的经济损失。自Corda于1831年建立炭疽菌属以来,经历了三次较大的变更,但其分类仍然十分混乱。有必要对该属真菌进行全面研究,明确种的概念,理顺该属真菌的系统学关系。本研究主要采集具有炭疽病病症的茄科、豆科、百合科、兰科、石蒜科、葫芦科植物的叶、茎、果实等为实验材料,以单孢分离法分离病原菌；同时从国际菌种保藏中心收集部分模式菌株进行比较研究。采用形态学结合多基因(肌动蛋白-ACT、钙调蛋白-CAL、几丁质合成酶A-CHSI、3-磷酸甘油醛脱氢酶-GPDH、核糖体内转录间区-ITS、微管蛋白基因基因-TUB2)分子系统学并辅以寄主范围的方法,确定分离物的分类地位,弄清以上3省的主要炭疽病病原,探讨形态指标和多基因系统学的分类价值。从云南、贵州、广西3省14市(县)的茄科等7科35属38种寄主共采集323份具有炭疽病病症的标本,分离得到190株菌株,表明该地区炭疽病非常普遍。其中豆科47株、百合科26株、茄科72株、石蒜科17株、兰科22株、葫芦科4株；五加科2株；并从荷兰微生物菌种保存中心等国际菌种保藏中心收集了6株模式菌株或可信度高的菌株参与比较研究。结合形态学、多基因系统学和寄主范围,将分离的190株菌株确定为22个分类单元。其中新种5个,分别为朱顶红炭疽菌(Colletotrichum cliviae Y. L. Yang, Zuo Y Liu, K.D. Hyde & L. Cai, sp. Nov.)、君子兰炭疽菌(C. hemerocallidis Y. L. Yang, Zuo Y. Liu, K.D. Hyde & L. Cai, sp. Nov.)、喀斯特炭疽菌(C. hippeastri Y. L. Yang, Zuo Y. Liu, K.D. Hyde & L. Cai, sp. Nov.)、蜘蛛兰炭疽菌(C. hymenocallidis Y. L. Yang, Zuo Y. Liu, K.D. Hyde & L. Cai, sp. Nov.)和萱草炭疽菌(C. karstii Y. L. Yang, Zuo Y. Liu, K.D. Hyde & L. Cai, sp. Nov.)。对朱顶红炭疽菌、君子兰炭疽菌、喀斯特炭疽菌、蜘蛛兰炭疽菌的致病性测试显示,该4种真菌没有严格的寄主专一性。中国新记录种5种,分别为C. brevispora Phoulivong, Noireung, L. Cai & K.D. Hyde、C. fructicola Prihastuti,L.Cai & K.D.Hyde.C.liriopes Damm,P.F.Cannon & Crous.C. siamense Prihastuti,L. Cai & K.D.Hyde和C. spaethianum(Allesch.)Damm,P.F.Cannon & Crous。已知种9种。全球近三十年来在科技论文中出现的炭疽菌属真菌仅为66个,在我国云南、广西和贵州3省的检出率就达到三分之一,表明该地区植物炭疽病比较普遍。豆类炭疽菌在我国贵州、云南和广西非常严重,共分离到41株,占分离总数的21.6%,是引起豆科豇豆、大豆,茄科辣椒的主要炭疽病病原,分别占该3种作物炭疽病病原检出总数的84.2%、69.4%和17.2%；此外也感染茄科的西红柿、茄子和石蒜科的蜘蛛兰。君子兰炭疽菌的寄主较广泛,能感染石蒜科、兰科、豆科、茄科的多种植物,但不严重,共分离到13株菌株,占分离总数的6.8%。2008年引起贵州凤冈县局部爆发的辣椒炭疽病的病原真菌为壳皮炭疽菌。胶孢炭疽菌的寄主范围相对较窄,仅从兰科万代兰属的某一种、茄科枸杞、百合科萱草共分离到10株,占分离总数的5.3%。本研究首次系统的对茄科、豆科、百合科、兰科、石蒜科植物进行炭疽病病原的分离和鉴定,弄清了该地区的炭疽病病原种类。在国内首次采用多基因系统学结合形态学方法识别炭疽菌属真菌,这一方法对该属及其它属的鉴定具有一定的借鉴价值。同时,本研究不仅在真菌学和植物病理学上具有重要的科学价值,而且在防治植物炭疽病、作物育种方面具有重要的实践意义,也有助于海关有效检疫。