【摘 要】
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人类白细胞抗原系统(human leukocyte antigen，HLA)的高分辨率、精准分型对于组织配型以及 HLA 相关疾病研究具有重要意义。该基因系统的变异与恶性肿瘤、器官移植、药物过敏反应以及自身免疫疾病等均有密切关系。 本研究以 12 位原发性肝细胞癌病人的外周血为供试样本，分析二、三代测序数据用于高分辨率 HLA 分型的优劣势，同时结合探针捕获与三代测序技术对YH、HeLa 标准细
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人类白细胞抗原系统(human leukocyte antigen，HLA)的高分辨率、精准分型对于组织配型以及 HLA 相关疾病研究具有重要意义。该基因系统的变异与恶性肿瘤、器官移植、药物过敏反应以及自身免疫疾病等均有密切关系。
本研究以 12 位原发性肝细胞癌病人的外周血为供试样本，分析二、三代测序数据用于高分辨率 HLA 分型的优劣势，同时结合探针捕获与三代测序技术对YH、HeLa 标准细胞系以及一个原发性肝细胞癌病人的主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex，MHC)区域进行靶向分析，探究长读长测序技术对于整个MHC区域精细分析的潜力。
研究表明：(1)二、三代测序技术均能实现6~8位高分辨HLA分型，且两者分型结果一致。但是三代数据的覆盖均一度显著优于二代，不会出现明显的“断层”现象；(2)超长的三代数据可直接跨越整个扩增子，对于基因单倍体型的判定(phasing)具有明显优势。样本中92.79%的HLA基因能够得到准确的单倍体分型结果，远高于二代的 75.65%；(3)长读长的三代测序数据不但能实现对 MHC 区域的更好组装，还具有对整个MHC共计3.6 Mb区域进行单体型判定的能力，而这将有助于明确各个突变位点、等位基因、非编码区等基因原件在每个MHC单倍体型上的定位与相互连锁信息，为免疫等相关疾病的研究提供理论依据。
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