太湖是我国第三大淡水湖泊，属于大型浅水湖泊，由于湖泊水体流量小、流速慢而封闭、水体置换周期长、污染胁迫压力大，生态系统自我恢复能力较差。近年来，太湖一直面临着严重的富营养化问题。根据以往的研究可知，浮游植物过量生长是富营养化的直接原因，而湖泊总氮、总磷是浮游植物生长的主要营养物质来源，此外，对于浅水湖泊，底泥营养盐释放也是导致湖泊富营养化的一个不容忽视的因素。因此本文在前人的研究基础上开展了如下工作： (1) 在水量模型的基础上，利用WASP5模型中的氮循环、磷循环、氧平衡以及浮游植物生长动力学理论，建立了浅水湖泊二维水量—水质耦合模型，并应用有限体积法和黎曼近似解的通量向量分裂格式(FVS)求解模型； (2) 利用建立的模型模拟2000年5月～8月太湖的流场和总氮、总磷、溶解氧及浮游植物的浓度场，为了分析风场、底泥分布对太湖流场和浓度场的影响，本文分别模拟了不考虑风场作用、考虑风场作用、考虑底泥分布以及考虑风场和底泥的共同作用四种不同运行模式下太湖流场和浓度场分布，并根据模拟结果分析流场和浓度场与太湖藻类爆发的相互关系。通过模型率定可知，建立的二维水量—水质耦合模型能很好的模拟太湖的流场和浓度场，具有较高的模拟精度； (3) 将模型应用于太湖的引调水方案设计中，分析太湖引调水方案对太湖流场和总氮、总磷浓度场的影响，确定引调水对太湖水质的改善作用，为大型浅水湖泊水环境污染控制及管理提供了理论依据。