仔猪肠道微生态系统的分子生态学研究

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该文首先对专利益生菌株YK-1R通过16SrDNA全序列分析的方法进行了菌种鉴定,在RDP数据库中比较分析后,表明其属于Bacillus subtilis,通过对芽孢杆菌属53个16SrRNA基因序列的系统进化对比分析,也表明YK-1R属于Bacillussubtilis所在的分支.根据已经克隆、测序的代表腹泻肠道优势菌的1.1kb片段的序列和代表与健康肠道相关未知菌群的2.7kb的片段的序列,通过设计特异性引物,可分别专一性扩增500bp的代表大肠菌群的产物和300bp代表健康菌群的产物.当用粪便总DNA做模板,两对专一性引物进行多引物PCR扩增时,腹泻样品中500bp条带几乎都以高亮度存在,而300bp条带则很弱或无,而健康无病的肠道中300bp的条带亮度很强,500bp条带亮度则很弱,或者检测不到.在用益生素YK-1R治疗腹泻恢复后的样品中,500bp条带很弱,而300bp条带的亮度明显增加,且强度超过500bp条带2-3倍,用抗生素治疗腹泻恢复后的样品中,500bp的条带亮度下降缓慢,300bp条带亮度在症状完全恢复后也与500bp基本相当.结果表明用大肠杆菌和健康相关菌群之间的消长动态变化可以成为反映肠道微生物菌群平衡的生物标记.
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