TRIM22基因单核苷酸多态性与宫颈癌的遗传易感性研究

来源 :广西医科大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:kuwowangzhen111
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目的:  了解三结构域蛋白基因22(tripartite motif protein22,TRIM22)rs7935564位点、rs1063303位点、rs10838543位点这三个位点的单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism,SNP)在本研究人群中的分布情况,并进一步分析rs7935564、rs1063303、rs10838543这三个位点基因多态性与宫颈癌的遗传易感性的关系。  方法:  在这次课题研究中,对病例患者(宫颈癌患者组)以及对照人群(宫颈良性病变患者组及对照组)进行检测研究,使用snap shot测序法对所有研究对象的TRIM22基因rs7935564、rs1063303、rs108385433个位点的基因多态性进行测序,并且采用Sanger测序法进行测序验证。为检验本次研究对象是否符合群体遗传学哈-温平衡定律(Hardy-Weinbergequilibrium,HWE),对本纳入研究的人群进行HWE检验,目的是检验所研究对象的群体代表性及可比性是否可靠。通过非条件Logistic回归分析校正年龄后,计算比值比(Odds ratio,OR)和95%可信区间(Confidentialinterval,CI),分析3个SNP位点基因多态性与宫颈癌的遗传易感性的关系。  结果:  1.TRIM22基因rs7935564位点:  1.1基因型频率在各组中情况如下:宫颈癌组的GG(40.7%)、GA(43.2%)、AA(16.1%),宫颈良性病变组的GG(61.6%)、GA(26.8%)、AA(11.6%),对照组的GG(56.0%)、GA(33.0%)、AA(11.0%)。统计学分析显示,癌组较良性组P=0.015,存在差异,较对照组P=0.120,没有差异;良性组较对照组P=0.611,没有差异。  1.2等位基因频率在癌组、良性组、对照组中情况如下:三组G等位基因依次为62.3%、75.0%、72.5%,A等位基因依次为37.7%、25.0%、27.5%。显示:癌组较良性组P=0.008,有差异,较对照组P=0.040,有差异;良性组较对照组P=0.559,无差异。  2.TRIM22基因rs1063303位点:  2.1基因型频率在各组中情况如下:宫颈癌组的GG(61.7%)、GC(33.3%)、CC(5.0%),宫颈良性病变组的GG(62.5%)、GC(31.3%)、CC(6.2%),对照组的GG(54.0%)、GC(37.0%)、CC(9.0%)。显示:癌组较良性组P=0.900,无差异;癌组较对照组P=0.440,没有差异;良性组较对照组P=0.428,无差异。  2.2等位基因频率在癌组、良性组、对照组中情况如下:三组G等位基因依次为78.4%、78.1%、75.5%,C等位基因依次为21.6%、21.9%、24.5%。显示:癌组较良性组P=0.949,无差异,较对照组P=0.516,无差异;良性组较对照组P=0.522,无差异。  3.TRIM22基因rs10838543位点:  3.1基因型频率在各组中情况如下:宫颈癌组的TT(61.7%)、TC(32.1%)、CC(6.2%),宫颈良性病变组的TT(61.6%)、TC(30.4%)、CC(8.0%),对照组的TT(63.0%)、TC(31.0%)、CC(6.0%)。显示:癌组较良性组P=0.873,无差异,较对照组P=0.945,无差异;良性组较对照组P=0.847,无差异。  3.2等位基因频率在癌组、良性组、对照组中情况如下:三组T等位基因依次为77.8%、76.8%、78.5%,C等位基因依次为22.2%、23.2%、21.5%。显示:癌组较良性组P=0.819,无差异,较对照组P=0.869,无差异;良性组较对照组P=0.673,无差异。  4.TRIM22基因三个位点的基因型和等位基因与宫颈癌、宫颈良性病变的患病风险评估  4.1TRIM22基因三个位点的基因型和等位基因与宫颈癌的患病风险评估  (1)rs7935564位点癌组基因型GA与对照组基因型GA比较(P=0.101,OR=0.449,95%CI=0.172~1.169),癌组基因型GA与良性组基因型GA比较(P=0.026,OR=0.271,95%CI=0.086~0.858),癌组与非癌组基因型GA比较(P=0.022,OR=0.364,95%CI=0.153~0.866),表明rs7935564位点基因型GA在癌组与非癌组间存在差异,癌组与良性组间存在差异,但不增加宫颈癌患病风险;癌组与对照组A等位基因比较(P=0.031,OR=0.609,95%CI=0.388~0.956),癌组与良性组A等位基因比较(P=0.006,OR=0.479,95%CI=0.284~0.806),癌组与非癌组A等位基因比较(P=0.004,OR=0.548,95%CI=0.364~0.825),表明rs7935564位点A等位基因突变在癌组与非癌组间存在差异,癌组与良性组间存在差异,癌组与对照组间存在差异,但不增加宫颈癌患病风险。  (2)rs7935564位点癌组与非癌两组基因型AA比较,rs1063303位点癌组与非癌两组基因型GC、基因型CC、C等位基因同参数组间比较,rs10838543位点癌组与非癌两组基因型TC、基因型CC、C等位基因同参数组间比较,结果显示均P>0.05,癌组与对照组比较P值分别为0.651、0.703、0.995、0.432、0.600、0.683、0.627,OR值分别为0.798、1.295、0.996、1.221、0.705、0.753、0.881,95%CI分别为0.301~2.119、0.343~4.896、0.252~3.929、0.742~2.012、0.190~2.610、0.193~2.937、0.530~1.467;癌组与良性组比较表明P值分别为0.346、0.846、0.932、0.787、0.738、0.615、0.956,OR值分别为0.569、1.152、1.067、1.081、0.773、0.670、1.016,95%CI分别为0.176~1.839、0.277~4.801、0.242~4.701、0.613~1.909、0.171~3.498、0.141~3.184、0.577~1.790;表明rs7935564位点从突变基因型,rs1063303位点、rs10838543位点基因突变在三组间无差异,与宫颈癌的患病风险无相关性。  4.2TRIM22基因三个位点的基因型和等位基因宫颈良性病变的患病风险评估  rs7935564位点基因型GA、基因型AA、A等位基因,rs1063303位点基因型GC、基因型CC、C等位基因,rs10838543位点基因型TC、基因型CC、C等位基因同参数对照组与良性病变组间比较,结果显示均P>0.05,差异无统计学意义,P值分别为0.452、0.585、0.450、0.913、0.928、0.739、0.761、0.921、0.435,OR值分别为1.529、1.381、1.210、1.074、0.941、1.091、0.806、1.076、0.812,95%CI值分别为0.506~4.622、0.433~4.405、0.738~1.983、0.300~3.840、0.251~3.534、0.654~1.820、0.201~3.230、0.257~4.510、0.480~1.371,表明rs7935564位点、rs1063303位点、rs10838543位点基因突变与宫颈良性病变的患病风险无相关性。  结论:  本课题研究结果显示:  1.宫颈癌组TRIM22基因rs7935564基因型和等位基因频率分布与宫颈良性病变组相比较有差异,其等位基因频率分布与对照组比较有差异,有统计学意义。  2.TRIM22基因rs7935564、rs1063303、rs10838543单核苷酸多态性与宫颈癌的患病风险无相关性。
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