我国作为发展中国家,在经济高速发展的同时,环境问题日益突出。为转变地区之间生态经济不平衡的现象,我国政府实施生态转移支付制度,通过对生态保护者和重点生态功能区进行资金补偿的方式来调整生态保护进程中相关方的利益关系。随着生态转移支付实施范围的扩大,加强生态转移支付资金绩效管理的重要性不言而喻,对生态转移支付资金绩效审计评价指标体系的构建必不可少。基于上述研究背景,首先进行了文献回顾,发现目前生态转移支付资金绩效审计的研究成果不足,指标设计思路缺乏整体性和系统性,未对各项指标设置量化的评分标准,本文针对这些不足之处对指标体系进行完善。通过相关理论的回顾,明确了生态转移支付和绩效审计评价的相关概念。公共受托责任论、可持续发展论和系统论为明确指标体系的构建思路提供了理论基础。在生态转移支付资金绩效审计评价指标体系的构建上,以审计目标为导向,针对现有指标体系存在的问题,以逻辑模型为内核,再根据构建原则,确定了指标内容、指标权重和评分标准。在指标内容方面,从投入、管理、产出和效益实现四个维度设计了一级指标,再根据具体审计目标设计了二级和三级指标。在指标权重确定上,采用层次分析法构建判断矩阵,确定了每一层次指标对上一层指标的权重,再对各层指标权重进行加权赋值。在评分标准设置上,区分了定性指标和定量指标的评分标准,分别给出了不同等级的评分范围。本文还将所构建的指标体系进行了案例应用,选取新安江生态转移支付项目作为案例应用对象,在了解其基本情况的基础上,明确了审计评价的主客体,给出了审计评价的实施程序,还得出了黄山市使用该项资金的绩效评价结果。最后,本文认为可以通过加强立法、创新审计方法和建立配套机制这些措施促进生态转移支付资金绩效审计评价指标体系的应用。