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目前,疫病是影响江西养猪业的重要因素之一,养猪生产上面临着疫病种类多、病原变异、多病原混合感染等问题。随着日龄的增长,母源抗体水平逐渐下降、断奶应激、疫苗免疫保护未完全形成等因素,保育猪是规模化养猪场中最容易发生疫病(尤其是多病原感染)的猪群。为了解江西地区保育猪的病原的感染及变异情况,本论文从江西部分猪场采集病(死)保育猪病料,采分子生物学方法分析猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪圆环病毒2型(PCV2)和猪伪狂犬病毒(PRV)四种病毒的感染情况,随机对部分毒株进行测序,分别了解病原的变异情况,为江西地区养猪场进行保育猪的疫病防控提供病原学依据。1.江西地区保育猪的病原感染情况调查2014年1月至2014年12月间,从江西省南昌、宜春、吉安、赣州、抚州、九江和上饶地区的不同规模养猪场采集546份病(死)保育猪病料,对每一份病料均分别进行了猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪圆环病毒2型(PCV2)和猪伪狂犬病毒(PRV)四种病病毒的PCR/RT-PCR检测。结果显示:PRRSV的阳性数为375,占总样品百分率为68.6%;CSFV的阳性数为204,占总样品百分率为37.3%;PCV2的阳性数为275,占总样品百分率为50.3%;PRV的阳性数为70,占总样品百分率为12.8%。2.四种病原的感染类型分析546份病(死)保育病料样品中,单独感染的样品为203份,占总样品数的37.1%;二重混合感染的样品为308份,占总样品数的56.3%;三重感染的样品为30份,占总样品数的5.4%;四重感染的样品为5份,占总样品数的0.9%。调查结果表明:保育猪的病原的多重感染普遍化,PRRSV、CSFV、PCV2和PRV的二重以上混合感染高达62.9%;二重感染中,以“PRRSV+PCV2”或“PRRSV+CSFV”感染为主,分别占二重混合感染的45.1%和31.8%。3.PRRSV、CSFV、PCV2和PRV的变异情况分析(1)12株猪瘟病毒江西流行株的E2基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.5%-100%和92.4%-100%;江西流行株与CSFV石门株的核苷酸同源性为82.6%-83.3%。通过E2基因的遗传进化树分析中,可将CSFV可分为两大基因群,即基因1群和基因2群,本论文测定的12株猪瘟病毒江西流行株均属于基因2群的2.1b亚群。(2)15株PRRSV毒株ORF5基因的核苷酸和氨基酸同源性为93.7%-99.7%和89.1%-100%。与美洲株(VR2332)的核苷酸和氨基酸同源性为82.4%-87.2%和80.2%-89.1%,与欧洲株(MLV)的核苷酸和氨基酸同源性为79.7%-86.6%和82.1%-86.9%。15株PRRSV江西流行株均属于美洲型。(3)11株PCV2江西流行株的核苷酸和氨基酸同源性为94.2%-99.7%和64.2%-93.2%。遗传进化树分析结果表明:11株江西毒流行株中9株属于PCV2b型,2株属于PCV2a型。(4)9株PRV江西流行株gB基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为94.7%-100%和99.5%-99.9%。与BARTHA-2011相比,核苷酸同源性为97.8%-97.9%,与KAPLAN相比,同源性为98.0%-98.2%。遗传进化树分析,9株流行株亲缘关系近。