在陆生植物中存在一个庞大的蛋白家族——PPR(Pentatricopeptide repeat)蛋白,自2000年其被定义分类以来,越来越多的研究表明,PPR蛋白是有由核基因编码,然后转运到线粒体或是叶绿体中,通过结合细胞器mRNA来参与到转录后调控过程中,其主要功能包括RNA的C到U的编辑、内含子的剪切、RNA的成熟稳定和参与蛋白质的翻译。随着研究的不断深入,人们已经开始探索解密PPR蛋白是如何识别RNA序列以及在各个转录后调控功能中复合体的其他成员。本研究以玉米的PPR蛋白ZmPPR41为研究对象,通过对该蛋白的基础功能研究表明,ZmPPR41属于PPR蛋白家族中E亚类的蛋白,该蛋白的亚细胞定位在线粒体中,并参与到线粒体基因rpl16的mRNA第48个位点的C到U的编辑过程,结合位点的预测分析显示ZmPPR41可以特异性的结合到rpl16的mRNA第48位编辑位点上游的碱基序列,通过编辑位点与PPR41的共进化分析显示,PPR41蛋白的功能进化过程可能是为了修复线粒体rpl16的编辑位点突变而产生,而且根据该共进化分析的预测,在水稻中验证了PPR41蛋白具有同样的编辑功能。至此,对ZmPPR41的研究不仅从基础理论方面清楚了单个PPR蛋白的功能,也为预测PPR蛋白与RNA结合位点的统计分析提供数据基础,更重要的是ZmPPR41的编辑功能并没有改变rpl16的氨基酸序列,这将为PPR蛋白与线粒体基因组的共进化分析提供的新的分析依据,使得共进化理论更偏向线粒体编辑位点突变诱发核基因蛋白的进化的假说,为将来的进一步分析提供理论基础。