中国汉族人口中GAB2基因中的单核苷酸多态位点rs3740677与迟发型AD的关系

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目的:本研究旨在探索生长因子受体结合蛋白-2的相关结合蛋白家族基因中的一个mi RNAs-185特异性靶向关联序列中的单核苷酸多态位点(SNPs)rs3740677与迟发型阿尔茨海默病(LOAD)发病的具体关联。方法:我们通过大样本病例对照研究,从青岛市立医院在内山东省内多家公立医院神经内科选取992例LOAD患者作为病例组,同时从青岛市立医院查体中心等多家合作医院选取1358健康正常人作为对照组,提取所有受试者外周血DNA。通过生物信息学方法从多个公开的生物学信息库中在目前已报道的所有在AD脑内差异表达的3’UTR mi RNAs的靶基因中筛选出在汉族人群中常见的AD易感基因GAB2,并用最终确定了3’UTR mi RNAs-185的特异性靶向序列中的一个常见的单核苷酸多态位点rs3740677。并利用多重高温连接酶检测反应(i MLDR)技术进行了相关基因分型。此外,我们还应用等位基因特异性多重PCR(Multi-ARMS)技术进行了APOE基因分型。最后我们应用SPSS19.0软件,采取t检验、卡方检验及Logistic回归分析等方法对相关数据进行统计学分析,得到相关统计学检验值:P值,OR值及其95%可信区间等,进而判断此SNP位点与北方汉族人群迟发性AD发病的可能关系。结果:GAB2 SNP rs3740677基因型显示等位基因“T”为最小频率等位基因。通过卡方检验,我们发现GAB2 SNP rs3740677的基因型与最小等位基因T在LOAD病例组与健康对照组间均存在显著统计学差异(基因型P=0.024;等位基因P=0.008)。此外,作为GAB2 SNP rs3740677的预期风险等位基因T,我们的卡方检验分析发现其可能对LOAD发病具有保护性作用(OR=0.833,95%CI=0.728-0.952)。通过对LOAD病例组以及健康对照组人群行进一步的APOEε4携带与否分层,我们通过卡方检验分析发现:无论在APOEε4+(携带)还是APOEε4-(非携带)条件下均未发现GAB2 SNP rs3740677基因型与最小等位基因T分布在两组间存在统计学差异(APOEε4+:基因型P=0.437,等位基因P=0.208;APOEε4-:基因型P=0.149,等位基因P=0.064)。此外,在经过发病年龄或检测年龄、性别、APOEε4携带状态等因素调整后,我们通过逻辑学回归分析检测了三个基因型遗传模态中的GAB2 SNP rs3740677基因型在两组中的分布差异。最终结果显示:在显性遗传模态以及叠加模态中发现了GAB2SNP rs3740677基因型分布的统计学差异,并且同样呈现一种对AD发病的保护性作用。而在隐性遗传模态中我们并未发现任何统计学意义(显性遗传模态:OR=0.831,95%CI=0.702–0.983,P=0.031;叠加模态:OR=0.855,95%CI=0.745–0.983,P=0.027;隐性遗传模态:P=0.252)。此外,我们更进一步的检测的三种模态中基因型分布与APOEε4状态的可能交互作用。最终,均未发现统计学意义。结论:我们的研究在北方汉族人群中首次证实了AD相关基因GAB2中一个3’UTR mi RNAs-185的特异性靶向序列中的常见SNPs rs3740677与LOAD发病的显著关联。而且SNPs rs3740677被进一步提示是一种对LOAD发病具有保护性作用的影响因素。
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