人赖氨酸特异性去甲基化酶LSD1小分子抑制剂的发现

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人赖氨酸特异性去甲基化酶(Human lysine specific demethylasel, LSD1)是胺氧化酶家族成员,在黄素腺嘌呤二核苷酸(Flavin adenine dinucleotide, FAD)的参与下,LSDl可以特异去除组蛋白H3上第四位(H3K4)和第九位(H3K9)赖氨酸残基上的二甲基和一甲基修饰。LSD1还能去除其它一些非组蛋白底物上的甲基化修饰,例如p53和DNMT1等。LSD1具有多种生物学功能,主要包括促进肿瘤增殖、抑制能量代谢、促进脂肪合成、抑制脂解和调控细胞分化等。2014年,EMA批准第一个LSD1特异型抑制剂ORY-1001进行一期临床试验,用于治疗急性髓系白血病。因此,LSD1成为潜在的药物作用靶标。我们从大肠杆菌表达系统中表达并纯化得到了GST融合表达的LSD1重组蛋白,利用Perkin Elmer公司的Lance试剂盒成功建立并优化了LSDl活性检测方法,建立了LSD1的高通量筛选(High throughput screening, HTS)模型。并对国家化合物样品库和国家新药筛选中心化合物库中的337563个样品进行筛选,得到284个抑制活性较好的化合物。其中37个样品ICso低于0.5μg/mL,抑制活性最好的化合物为WNN0649-F005,其抑制LSD1的IC50为0.012μg/mL,与进入临床一期的化合物ORY-1001抑制IC50相当。我们进一步利用MTS方法检测了部分化合物对THP-1、HL-60和RPMI8226三株肿瘤细胞株增殖抑制的情况和对胺氧化酶MAOA的选择性抑制活性,最终发现化合物WNN0649-F005和WNN0819-F004对这三株细胞具有较好的增殖抑制活性,同时部分LSD1化合物同样具有对MAOA抑制活性。综上所述,我们通过建立LSD1的高通量筛选模型,筛选获得一批对LSD1活性抑制较好的化合物,并通过MTS方法验证了化合物抑制肿瘤细胞增殖的效果。为进一步的化合物结构改造和抗肿瘤的药物发现打下了基础,具有重要的研究价值和应用前景。
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