内蒙古自治区高校自实施“体教结合”以后,已经取得了显著的成果,但在发展的同时也遇到了许多问题。本文通过研究发现内蒙古高校高水平运动队目前存在运动员组成体系不合理、管理不完善、教练员整体素质有待提高等问题。本文深刻剖析阻碍其发展的因素,为高水平运动队在内蒙古自治区更好的发展提供一定的理论依据,探索出一条内蒙古自治区高水平运动队的可持续发展道路,以推动内蒙古自治区竞技体育更好更快的发展。本文通过运用文献资料法、调查研究法、专家访谈法、理论分析法等方法分析内蒙古四所高校建设高水平运动队的现状及发展问题,得到了以下几方面的结论：内蒙古高校高水平运动队的项目设置比较单一,主要是田径和球类项目；内蒙古四所试办高水平运动队的高校,相对其它省市而言运动队规模较小、整体运动水平不高；缺乏高、精、尖人才,运动员组成体系不合理；缺乏高素质的教练员；内蒙古高校高水平运动队都存在经费缺乏的问题,使得运动队难以扩大规模和提升层次；内蒙古高校竞技体制及对高水平运动队建设的管理不够完善。针对目前内蒙古高校施行“体教结合”过程中存在的问题,建议可以通过建立后备人才基地,加强高质量后备人才队伍建设；加强项目布局研究,建立资金投入多元化和现代化的竞技体育优势项目训练基地；提高教练员的素质,引进高水平的教练员；建立基于团队的、基于项目的组织结构等措施加以解决。