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HCV是输血后肝炎的主要病因之一,感染后慢性化率高,部分慢性感染者可发展成为肝硬变及肝癌。HCV属黄病毒科,为单股正链RNA病毒。由于RNA复制酶的差错率较高,HCV基因组表现出很高的变异率。变异可能是HCV逃避获得性免疫系统的压力,在宿主体内持续感染的机制之一。我们对两例慢性HCV携带者及一例HCV RNA转阴者的HCV HVR1及NS3区部分区段测序,研究包含B细胞抗原表位(HVR1)和CTL抗原表位区段(NS3)的演变规律。 本研究选择两例HCV持续感染者,一例HCV RNA转阴者,分三个时间点对两个区段进行五年随访研究。采用单链手工测序的方法,连续观察HCV两个区段5年中的变异情况(HVR1平均每个时相测27个克隆,NS3每个时相测5个克隆的序列)。三例感染者用抗体进行HLA分型。分析序列资料时,建立了通用软件和免费序列分析软件相结合的分析方法。编写了预测T细胞抗原表位的软件GUOTIF(http://www.fmmu.edu.cn/GUOTIF.htm)。 研究有如下发现: 1.三例感染者的HCV基因分型为1b,三者感染源可能相同,或存在交叉感染。 2.流产株可能是HCV感染中的一种普遍现象。 3.两例携带者表现了两种不同的演化模式,@表现为共有序列快速演化,同一时间点的序列较均一。#表现为共有序列演化较慢,同一时间点的序列异质性高。HLA分型表明两者MHC有很大差异。 4.HVR区的研究发现,①@较#处于较大的中和抗体压力之下。②转阴者与携带者的序列比较发现,仅从相似株的复杂度和平均遗传距离很难判断预后。 5.NS3区的研究发现,①NS3区的演化可能是CTL免疫压力作用的结果。②受螺旋酶的结构功能限制,NS3区测序区段的错义突变很少,出现的错义突变对螺旋酶二、三级结构的影响很小。 总之,研究发现测序区段的演化,可能与相应的体液、细胞免疫压力有关,免疫逃避可能是病毒演化的动力。病毒与免疫这对矛盾在不同的感染者有不同的表现形式,可能与不同感染者的特定免疫遗传背景及病毒相似株有关。