计算机辅助药物设计对FXa抑制剂和苯并噻唑衍生物的研究

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凝血因子Xa(FXa)是新的抗凝治疗一个特别有希望的靶标。第一种口服Xa因子抑制剂已在欧盟和加拿大于2008年被批准上市。在本文中,38个[6,6,5]三环稠合的恶唑烷酮类分子采用3D-QSAR(三维定量构效关系)、分子对接、分子动力学和Topomer CoMFA来建立三维构效关系模型。CoMFA(比较分子场分析)模型的q2=0.511和tr=0.984,COMSIA(比较分子相似性分析)模型的q2=0.700和r2=0.993,Topomer CoMFA模型的q2=0.377和r2=0.886。结果表明立体场、疏水场、氢键受体场和静电场在模型中发挥关键作用。分子对接和分子动力学探索了配体和受体蛋白之间相互作用的机制。苯并噻唑是一个重要的药效结构,在医药领域有着广泛的应用。苯并噻唑2-取代化合物对人肝癌细胞HepG2有着一定的抗增殖活性。在本文中,对31个苯并噻唑衍生物采用了3D-QSAR和Topomer CoMFA来建立三维构效关系模型。CoMFA模型的q2=0.653和r2=0.921,COMSIA模型的q2=0.708和r2=0.917,Topomer CoMFA模型的q2=0.386和r2=0.649。计算结果表明: (1)较大的R1基团和较小的R2基团有利于活性;(2)R2基团可以通过在4-和6-取代位引入疏水性基团来提高活性。这些结果都表明了3D-QSAR模型是可靠的,可以用来预测新化合物的活性。
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