牛Dlk1-Dio3印记区域3个基因间lncRNA印记状态分析

来源 :河北农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wufala
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因组印记(Genomic imprinting)是哺乳动物中来源于亲本的等位基因由于DNA甲基化、组蛋白乙酰化等表观遗传(Epigenetic)的不对称修饰而导致单等位基因表达的现象,即来自双亲的等位基因一方沉默,而特异性地表达另一方,具有这种现象的基因称为印记基因(Imprinted gene)。大部分印记基因成簇存在并在物种间保守。基因组印记与生物进化、性别决定、生长发育以及肿瘤的发生密切相关。  长非编码RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200nt能转录但不编码蛋白质且具有特定功能的RNA分子。目前发现在人中lncRNA的数量是编码蛋白基因的两倍以上。LncRNA与编码蛋白的基因一样在生物体的分化、发育、致病等多种生命过程中起作用。位于印记基因成簇内的lncRNA参与调控印记基因的表达。Dlk1-Dio3印记区域由于在胚胎发育、细胞分化过程中的重要作用而备受关注,是目前研究比较充分的印记区域之一。该区域中母源ncRNA基因的异常表达与诱导多功能干细胞(iPSCs)的发育潜能直接相关。  随着转录组测序的进行,一些未知功能的EST序列定位在牛Dlk1-Dio3印记区域,本研究选取其中三组EST序列(第一组为CB457990和CB460301,第二组为AV603291和AV603290,第三组EE898001、AW446868、以及EE898002),首先设计跨EST序列的引物验证每组中的EST序列是否为来源于同一个基因的片段,并根据雨果基因命名委员会(The HUGO Gene Nomenclature Committee,HGNC)的基因命名原则将其命名为LINC24061、LINC24063和LINC24064;进而应用RT-PCR对这三个lncRNA在不同组织中的表达进行了分析;最后应用基于单核苷酸多态(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)的测序方法对LINC24061、LINC24063和LINC24064等位基因特异性的表达进行了鉴定。  结合RACE与RT-PCR技术得到LINC24061基因的两个可变剪切体LINC24061-v1与LINC24061-v2,组织特异性表达研究发现LINC24061-v1在心脏、肾和肌肉3个中表达,而LINC24061-v2在被检测的8个组织(心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪及大脑)中均表达。LINC24063与LINC24064在被检测的8个组织中都有表达。以SNP位点筛选出的杂合子个体为基础,通过RT-PCR技术及直接测序对LINC24061、LINC24063及LINC24064进行等位基因特异性的表达研究结果发现在成年牛8个组织中(心、肝、脾、肺、肾、肌肉、脂肪及大脑),LINC24061、LINC24063及LINC24064都为单等位基因表达,即它们都是长非编码RNA印记基因。以上研究结果将为研究这些lncRNA功能奠定基础。
其他文献
  针对"电子技术"理论及实践课程存在的问题,以培养学生创新能力为目标,对"电子技术"理论与实践课程内容进行改革优化。总结分析了目前"电子技术"课程存在的问题,分别对理论、
  针对测控技术与仪器专业课程特点,构建了以信息流为主线的课程体系,引导学生形成科学思想,培养学生的创新思维。改革了教学方法,建立了以学生为主体的研究性教学模式,注重培养
  考试是高校教学工作的重要环节,是提高教学质量、检测教学效果和培养人才的有效手段。但传统的考核方式严重制约了考试作用的发挥,不利于创新人才的培养。因而,高校应积极加
水库进水塔是一种体型结构、边界条件和受力情况比较复杂的水工建筑物,一般采用钢筋混凝土薄壁空腹箱形结构,建在靠近岸边的水库中,顶部用工作桥与河岸连接,其外围四周皆承受
本文采用有限元、统计模型和灰色关联度等分析方法,对面板堆石坝堆石体的湿化变形的相关问题进行了研究。主要研究内容如下:(1)分析了湿化变形的计算原理,探讨了湿化变形有限元
心肌细胞膜上存在着两种不同电流特性的钙通道:L 型钙通道和T 型钙通道。与 T 型钙通道相比,L 型钙通道具有大电导、高电压激活、长时间开放、能和多种拮抗剂作用的特点。就功
对人类晚期癌症基因组的分析发现1p36基因组片段经常被缺失,从而诞生了一个被大量的文献报道所支持的观点:一个强有力的肿瘤抑制因子位于1p36的基因组片段内。尽管有几个基因被
利用水库汛期分期汛限水位调控洪水资源,是处理水库防洪与兴利矛盾、实现洪水资源安全利用的重要技术途径,对缓解流域水资源短缺、实现水资源可持续利用具有重要的现实意义。
‘温185’核桃是新疆南疆盆地特色林果业的主要种植品种之一,其主枝开张为45°的疏散分层形树形居多,随着其栽种面积的增大,田间管理的问题日益凸显,比如日常管理不及时,树冠
虚拟水是解决水资源短缺问题和水资源安全问题的新概念,指生产产品和服务的用水量。本文在简要分析论述宁夏水资源短缺问题的基础上,引出了虚拟水概念,系统地计算了宁夏主要农作