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矮化育种是小麦改良中最重要的育种目标之一,不仅有助于抗倒伏和提高收获指数,而且能促进水肥利用效率,提高产量和品质,满足粮食需求。本研究以EMS诱变京411(WT)获得的两个小麦矮秆突变体(暂命名为je0199和je0124)为材料,综合利用转录组分析、激素敏感型鉴定及激素含量测定,揭示je0199的潜在矮化机制;通过BSR-Seq、BSA-660k芯片分析及遗传连锁图谱构建定位突变体中的矮秆基因。主要研究结果如下:
1、对孕穗期WT和je0199的穗下第一节及紧邻节间整体进行转录组测序(RNA-Seq)分析,共获得804个差异表达基因,其中469个基因上调,335个基因下调。对激素相关差异表达基因进行验证表明,定量PCR验证结果与转录组表达谱结果一致。与激素相关的差异表达基因主要为生长素合成及转运相关基因,其次为赤霉素调控相关基因。在分别进行赤霉素和生长素处理时,京411与je0199均为赤霉素敏感型,但对生长素的响应不同。分别测量WT和je0199节中GA3与IAA的含量和节间中GA3与IAA含量,测定结果表明,je0199节中的GA3含量显著低于WT,其它均没有显著性差异。综上表明,生长素和赤霉素的综合作用影响了je0199植株矮化。
2、利用2017年农大5181/je0199F2群体的高、矮秆极端混池进行BSR-Seq,je0199/农大5181F2群体以及农大5181/je0199F2群体极端表型单株混池进行660k芯片扫描,均在5A染色体检测到一个矮秆基因位点;进一步通过分子标记开发结合2017年和2018年的F2群体进行遗传连锁图谱构建,将je0199中矮秆基因定位在5A染色体404Mb~504Mb区间,分析表明该基因可能为一个新发现的矮秆基因。
3、利用je0124/农大5181F2群体和农大5181/je0124F2群体进行660kSNP芯片扫描,并进一步通过分子标记的开发和遗传连锁图谱构建,将je0124中矮秆基因定位到2D染色体长臂KASP标记ph-3和ph-4之间约1.36cM区间,分析表明该矮秆基因可能是唯一发现的定位于2DL的矮秆基因。
1、对孕穗期WT和je0199的穗下第一节及紧邻节间整体进行转录组测序(RNA-Seq)分析,共获得804个差异表达基因,其中469个基因上调,335个基因下调。对激素相关差异表达基因进行验证表明,定量PCR验证结果与转录组表达谱结果一致。与激素相关的差异表达基因主要为生长素合成及转运相关基因,其次为赤霉素调控相关基因。在分别进行赤霉素和生长素处理时,京411与je0199均为赤霉素敏感型,但对生长素的响应不同。分别测量WT和je0199节中GA3与IAA的含量和节间中GA3与IAA含量,测定结果表明,je0199节中的GA3含量显著低于WT,其它均没有显著性差异。综上表明,生长素和赤霉素的综合作用影响了je0199植株矮化。
2、利用2017年农大5181/je0199F2群体的高、矮秆极端混池进行BSR-Seq,je0199/农大5181F2群体以及农大5181/je0199F2群体极端表型单株混池进行660k芯片扫描,均在5A染色体检测到一个矮秆基因位点;进一步通过分子标记开发结合2017年和2018年的F2群体进行遗传连锁图谱构建,将je0199中矮秆基因定位在5A染色体404Mb~504Mb区间,分析表明该基因可能为一个新发现的矮秆基因。
3、利用je0124/农大5181F2群体和农大5181/je0124F2群体进行660kSNP芯片扫描,并进一步通过分子标记的开发和遗传连锁图谱构建,将je0124中矮秆基因定位到2D染色体长臂KASP标记ph-3和ph-4之间约1.36cM区间,分析表明该矮秆基因可能是唯一发现的定位于2DL的矮秆基因。