目的：检测甲胎蛋白基因RS12506899, RS16849384, RS7688274,三位点基因型在广西地区原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)患者中的分布,探讨候选基因型对患者血清甲胎蛋白(α-fetoprotein, AFP)水平以及临床病理生物学行为是否存在影响。方法：选取广西医科大学一附院和广西医科大学肿瘤医院2005年3月～2011年3月期间HCC患者177例。所有病例行肝癌切除手术治疗,提取其肿瘤组织DNA,通过实时荧光聚合酶链式反应(RealTime PCR) Taq-man法进行基因分型。对各组基因型间AFP水平及临床病理特点进行比较。结果：采用卡方检验和方差分析对比不同基因型各组间AFP水平、肿瘤直径、乙肝表面抗原的分布情况,差异无统计学意义。无肝硬化的HCC患者AFP水平高于合并肝硬化的HCC患者(P=0.047)。单因素生存分析结果提示p53抗体阳性程度越高,其无瘤生存时间越短(P=0.010)结论：在本组研究人群中,甲胎蛋白候选基因型与HCC患者的AFP水平及其临床参数不相关。