乳酸菌(lactic acid bacterium,LAB)是一种分布广泛的细菌,在植物、自然发酵产物以及人和动物肠道中都有发现。大部分乳酸菌在食物发酵和保藏工艺中拉扮演重要的角色。乳杆菌属包含了190个已经验证的种,其中6个种的基因组已公开发表。Lactobacillus shenzhenensis LY-73~T菌株是从发酵物中分离出来的一个乳杆菌属的新种。本研究通过16s rRNA和生理生化试验对一株从发酵饮料中分离得到的乳酸菌进行鉴定,结合基因和表型特征分析确定它属于一个新种,并将其命名为:Lactobacillus shenzhenensis sp.nov.,同时利用Illumina Hiseq 2000测序技术对其进行全基因组测序,最终得到62条Scaffold,长度范围从543 bp~446,731 bp,基因组全长3,271,684 bp,GC含量约56.44%。基因预测得到3,188个ORFs,ORF平均长度为890 bp。使用SWISSPORT、COG和KEGG数据库对得到的ORF进行注释,其中有72%即2,296个基因被注释为已知功能基因,全基因组约有87.4%的序列被预测为编码蛋白的基因。通过KEGG代谢途径的分析发现LY-73~T包含有22个假定的双元件调节系统,这使其具有在复杂环境条件中生存的可能性,此外还发现了一些编码与疾病通路相关的基因以及编码细菌素的基因,因此该菌株在保健品开发和食品保藏开发中具有一定的开发潜力和产业价值。本研究对LY-73~T菌株基因组的分析可帮助乳酸菌开发人员从分子水平了解同类菌株的生理特征,并为后续的功能实验验证提供理论基础;同时也为后期对该菌株的改造奠定分子基础,也为乳酸菌基因组数据库补充了研究数据。