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我国现阶段伴随着经济的高速发展，生态环境频频发出的警报，我国推行主体功能区划，将区域进行分类，制定分类政策，差别化管理，将为我国的经济社会发展提供新的思路。推进主体功能区，是我国发展政策的一次创新，是一项开拓性的工作。开展主体功能区划，国内外都没有现成的理论和方法可以参考，并且不同于国内现有的各种区划和规划。所以，对于主体功能区划相关问题及其分类政策的深入研究具有重要的理论意义和和重大的现实意义。
本论文旨在“推进主体功能区划”的政策背景下，研究主体功能区划，并试图将生态补偿引入主体功能区划中，建立完善的生态补偿机制。选择山西省忻州市主体功能区划的具体案例，根据生态功能区划机制，设计区划后的生态补偿分类政策框架。通过案例研究，建立生态补偿机制下的主体功能区划分类政策体系，希望能为政府、相关部门和机构制定政策提供参考。
本论文以经济学、生态学、可持续发展理论等多学科理论为基础理论，以规范研究、实证研究为基本研究方法，采用归纳、演绎等逻辑分析法、数理统计样本分析法、定性与定量相结合等方法，借鉴国内外生态补偿的经验，通过图表分析、数据测算等定量分析，建立生态补偿机制体系，并以特定区域为研究对象进行实证研究，设计以生态补偿为基础的主体功能区分类政策体系，希望能对其他类似地区提供参考和借鉴。
本文分五个部分，各部分的主要内容如下：
第一，从理论和现实两个方面论述了开展主体功能区划研究的的重大意义，并且明确研究方法，制定切实可行的技术路线，利于研究有序的进行；
第二，梳理了地理区划及相关理论的国内外研究进展和实践现状，以探寻主体功能区划的准确理论定位，为进一步研究区划方法，制定区域分类政策提供理论依据；
第三，系统地归纳总结主体功能区划的理论体系，透彻理解主体功能区划的涵义，发掘其理论基础，建立主体功能区划的区划方法，为案例区的主体功能区划提供理论参考和操作依据：
第四，在对案例区山西省忻州市生态经济发展状况研究的基础上，参照主体功能区划的区划方法，对案例区进行主体功能区划分，将其划分为4大类主体功能区和12个亚区：
第五，在主体功能区划的视角和基础之上，引入生态补偿机制，在吸取国内外实践经验的基础上，结合案例区的实际情况，在案例区主体功能区划的基础上.设计以生态补偿机制为基础的分类政策体系。然后探讨了如何保障分类政策的有效实施。
本文的研究贡献在于：第一，通过对地理区划理论及实践的梳理，探寻主体功能区划准确的理论定位；第二，将生态补偿机制引入主体功能区划的分类政策中，探讨生态补偿机制之上的主体功能区划的分类政策的制定，并设计了一套分类政策体系；第三，为其他地区开展主体功能区划分，并建立以生态补偿机制为基础的分类政策提供一定的参考和借鉴。