脂蛋白脂肪酶(lipoprotein lipase，LPL)是脂质代谢的关键酶。本实验从天府肉鹅腿肌中抽取总RNA，通过RT-PCR反应扩增LPL基因的部分mRNA序列，分析LPL基因的结构特征及序列变异特点，探讨LPL基因的结构与功能及其在脂肪酶超家族基因间的系统进化关系。结果表明： 1、获得的LPL基因序列长度为879bp，GenBank登录号为EF620913编码293个氨基酸，核苷酸序列与鸡LPL的mRNA具有92-38％的相似性，与其它物种的序列也具有较高的相似性。 2、鹅LPL基因的氨基酸组成包含20种氨基酸，其中亮氨酸含量(8.90％)最高，赖氨酸(7.88％)次之，色氨酸(1.37％)和蛋氨酸(1.74％)含量较低；鹅LPL基因293个氨基酸序列与鸡LPL基因间存在13个氨基酸位点的变异，占全部位点的4.44％：与哺乳动物间存在91个氨基酸变异位点，其中单态变异位点44个，占总变异位点数的48.35％。 3、在天府肉鹅LPL蛋白中，α-螺旋(α-helix)所占的比例较高，为31.85％，扩展链(Extended strand)的比例为20.89％，无规卷曲(Random coil)的比例为47.26％，三者交替分布，形成LPL蛋白的二级结构。 4、天府肉鹅LPL结构中存在4个二硫键、3个N-链接糖基化位点、1个肝素结合位点、1个脂蛋白酶催化三联体位点、1个脂质结合位点、1个介导脂蛋白与LDL受体结合的位点，1个PLAT结构域和1个对LPL二聚体形成必须的基序(motif)，这与已经报道的其它物种的相一致。 5、对脂肪酶蛋白超家族LPL、EL、HL、PL和PLAl 5个成员蛋白家族的进化分析表明，它们在结构上相似，来自一个共同的祖先基因；脂肪酶超家族在进化的过程中，形成2个进化分枝，即LPL-EL-HL分枝和PL-PLAl分枝，表明LPL、EL和HL基因间的亲缘关系较近；PL基因与PLAl间的分歧时间较晚。