抗生素FR-008生物合成基因簇部分功能区域的分析

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抗生素FR-008是一种七烯大环内酯类抗真菌抗生素。它以对氨基苯甲酸(PABA)为起始单位,通过聚酮合成途径形成内酯环。已克隆的聚酮合酶基因簇约为105kb,是研究杂合抗生素和大分子DNA克隆的理想材料。本文尝试在抗生素FR-008生物合成基因簇中,寻找与糖基合成有关的基因或调节因子,并试图改变PKS基因簇从而创造新抗衍生物,同时还对SCP2*载体系统用于大基因簇的克隆进行了初步的探索。 pabAB基因上游18kb的非PKS区域内存在着与抗生素FR-008合成有关的基因,对该区域的功能进行初步的研究。利用基因置换实验获得pabAB上游5.2kb片段发生缺失的基因置换突变株HJ1,并通过Southern杂交进行了验证。突变菌株HJ1丧失了合成抗生素FR-008的能力,表明该片段内存在与抗生素合成直接相关的基因。以高度相似的杀念菌素合成基因簇中对应区域的核苷酸序列为参照进行分析比较,暗示5.2kb片段内可能存在着调节抗生素合成的转录激活因子。 尝试利用截短PKS基因簇的途径发掘新的活性物质。首先以质粒pHZ1358为载体,构建出分别置换40kb、7kb和20kb PKS区域的基因置换结构pHZ2039、pHZ2012和pHZ2016。将前两个质粒导入链霉菌FR-008,获得基因置换突变株HJ8和HJ9。生物学活性检测和HPLC分析的结果都表明在突变菌株中可能有新的活性物质产生,其化学结构有待鉴定。 分别选取基因簇最左端的1.5kb BglⅡ-BamHⅠ片段和位于PKS区域内的4.0kb BamHⅠ-BglⅡ片段作为同源交换序列,以SCP2~*衍生质粒pIJ903为载体,构建了用于克隆大片段DNA的质粒pHZ2029。通过基因置换获得缺失约80kb片段的突变菌株HJ5。尝试将置换下来的大分子DNA经过链霉菌种间接合转移过程导入到异源宿主变铅青链霉菌或天蓝色链霉菌中,但没有成功。
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