弓形虫致小鼠不良妊娠原因的RNA-Seq分析

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弓形虫可以感染温血动物几乎所有的有核细胞,世界上感染弓形虫的人数大于人口总量的30%,口腔、血液、胎盘均是发生弓形虫感染的重要途径。孕期弓形虫感染导致妊娠异常的比率是正常孕妇的三倍,导致的不良影响主要表现为不孕、流产、胎儿重吸收、死胎及产出弓形虫携带者。弓形虫可入侵包括子宫在内的多种脏器,并通过如直接损伤子宫、破坏子宫内环境、损伤下丘脑破坏激素调节平衡等多种方式来影响妊娠结局。RH株是国际标准I型虫株,小鼠对其具有高度敏感性,腹腔感染72 h内可在子宫几乎所有种类的细胞的胞浆中检测到弓形虫虫体。转录组测序可以帮助研究者有效地获得机体的基因表达状况和转录调控规律,从而对弓形虫影响机体的生长发育和疾病发生的原因及潜在途径进行全面地分析。利用RNA-Seq技术结合后续的生物信息学分析,可以从基因的差异表达挖掘出导致妊娠异常的关键分子,或从差异基因富集通路的角度解释弓形虫急性感染与某些对妊娠有影响的并发症间的联系。本研究的目的是寻找弓形虫感染致不良妊娠结局的关键基因和通路,以及弓形虫速殖子在孕期如何对宿主具体的妊娠有关的基因进行干扰。我们采用弓形虫RH株速殖子,分别感染妊娠前3天,妊娠后3天以及着床后3天的昆明雌鼠,以与实验组相同时间的生理盐水处理组为对照组,对感染后3天的不良妊娠鼠的子宫样本进行转录组测序,三组分别检测到4561、2345和2997个显著差异表达基因。我们选择了10个上调和下调的差异表达基因进行荧光定量PCR的验证。并对差异表达基因进行GO注释和KEGG pathway分析,得到差异表达基因与解剖结构发育、转运、细胞分化、胚胎发育、激素生物合成过程、免疫反应等密切相关,且多分布于吞噬、癌症、细胞因子-细胞因子受体等通路。分析发现癌症通路是三个实验组中差异变化最为显著的通路之一,Wnt signaling pathway又在癌症通路中变化最为显著,且该通路中的Wnt/β-catenin经典通路与胚胎植入和胚胎发育都有密切的关系。通过进一步分析,我们发现弓形虫影响妊娠结局的因素有许多,弓形虫感染引发的妊娠高血压、对子宫内环境的破坏、对胎盘的形成和功能的阻碍以及直接影响胚胎的正常发育都可造成妊娠不良的后果。根据最终的分析结果,我们筛选出几个弓形虫感染后与妊娠密切相关的显著差异表达基因,如Hsd11b2、Ifitm1、CD74、CXCL14等,这些差异表达基因转录水平的变化很可能是弓形虫急性感染引起不良妊娠的原因之一。我们的研究可能有助于鉴定参与弓形虫感染后引发不良妊娠结局的关键基因和通路,并从基因转录差异变化的角度更好地了解弓形虫急性感染孕妇导致不良妊娠结局的原因,并有助于进一步开发新的妊娠期弓形虫病的治疗方法。
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