论文部分内容阅读
目的探讨福建泉州地区汉族人群类风湿关节炎(RA)患者白介素-1 a(IL-1a)、白介素-1β(IL-1β)、白介素-6(IL-6)、白介素-10(IL-10)及β-肿瘤坏死因子(TNF-β)等炎症相关因子的11个单核苷酸多态性(SNP)位点的分布特征,研究其与RA易感性的关系。方法(1)选取福建泉州地区汉族人群RA患者155例(RA组)和健康体检者170例(对照组)为研究对象,采用全血三引物等位基因特异性扩增(TRIP-ASPCR)技术检测上述5个炎症因子的11个SNP位点(IL-10 rs1800893、IL-6 rs1800796、IL-6 rs2066992、IL-1βrs16944、IL-1βrs1143623、IL-1a rs17561、IL-1a rs1894399、IL-1a rs3783550、IL-1a rs1800587、TNF-βrs2009658、TNF-βrs1041981)的基因型。(2)应用SPSS19.0软件及网络生物信息工具,采用卡方检验、t检验、logistic回归分析方法,对325例研究对象的11个SNP位点数据进行Hardy-Weinberg遗传平衡吻合度检验,分析各基因型和等位基因在福建泉州地区汉族人群的分布频率,以统计学指标P<0.05为相关性明显,以P>0.05为相关性不明显,并对有统计学意义的SNP位点等位基因进行RA发病关联强度指标OR的统计分析,以OR>1为与RA正相关。(3)应用SHEsis软件对所选SNP位点进行连锁不平衡分析和单倍型分析,连锁不平衡系数用Dˊ=D/Dmax,Dˊ>0.70有意义,r2>0.33有意义,单倍型分析时以OR>1为与RA正相关。结果(1)对照组IL-6 rs1800796、IL-1a rs3783550、IL-1a rs1800587和TNF-βrs1041981等4个SNP位点符合(P>0.05)Hardy-Weinberg平衡检验;RA组IL-10rs1800893和IL-1a rs1800587等2个SNP位点符合(P>0.05)Hardy-Weinberg平衡检验。(2)IL-10 rs1800893、IL-6 rs1800796、IL-6 rs2066992、IL-1βrs16944、IL-1a rs17561、IL-1a rs3783550、TNF-βrs2009658和TNF-βrs1041981等8个SNP位点的等位基因频率在对照组和RA组间的分布差异存在统计学意义(P<0.05,OR>1),与RA呈正相关,且相关性明显;IL-1βrs1143623、IL-1ars1894399和IL-1a rs1800587等3个SNP位点的等位基因频率在对照组和RA组间的分布差异不存在统计学意义(P>0.05),与RA的相关性不明显。(3)IL-6rs1800796和IL-6 rs2066992位点间存在连锁不平衡(D′=0.820,r2=0.151);IL-1βrs16944和rs1143623位点间不存在连锁不平衡(D′=0.121,r2=0.009);IL-1ars17561、IL-1a1894399、IL-1ars3783550、IL-1ars1800587等4个SNP位点间互不存在连锁不平衡关系(D′=0.06,0.390,0.107,r2=0.00,0.0.15,0.0001),TNF-βrs2009658和TNF-βrs1041981位点间不存在连锁不平衡(D′=0.465,r2=0.003)。IL-6 rs1800796和IL-6 rs2066992的单倍型频率分布在对照组和RA组之间的分布差异存在统计学意义(P<0.05),G T为与RA呈正相关,且相关性明显的单倍型(P=3.33e-16,OR=22.765);IL-1a rs17561、IL-1a rs1894399、IL-1ars3783550和IL-1a rs1800587的单倍型频率分布在对照组和RA组之间的分布差异存在统计学意义(P<0.05),G T A A为与RA呈正相关,且相关性明显的单倍型(P=0.0037,OR=29.413);TNF-βrs2009658和TNF-βrs1041981的单倍型频率分布在对照组和RA组之间的分布差异存在统计学意义(P<0.05),A C为与RA呈正相关,且相关性明显的单倍型(P=0.041,OR=1.443);IL-1βrs16944和IL-1βrs1143623单倍型频率分布在对照组和RA组的分布均不存在显著性差异(P>0.05)。结论(1)IL-1a、IL-1β、IL-6、IL-10和TNF-β等5个炎症相关因子的11个SNP位点中,有8个SNP位点(IL-10 rs1800893、IL-6 rs1800796、IL-6 rs2066992、IL-1βrs16944、IL-1a rs17561、IL-1a rs3783550、TNF-βrs2009658和TNF-βrs1041981)与福建泉州地区汉族人群的RA呈正相关,且相关性明显;IL-10rs1800893等位基因G、IL-6 rs1800796等位基因G、IL-6 rs2066992等位基因T、IL-1βrs16944等位基因G、IL-1a rs17561等位基因G、IL-1a rs3783550等位基因C、TNF-βrs2009658等位基因C和TNF-βrs1041981等位基因C可能作为福建泉州地区汉族人群RA的一个潜在遗传标志。(2)IL-1a的4个SNP位点(rs17561、rs1894399、rs3783550、rs1800587)、IL-6的2个SNP位点(rs1800796、rs2066992)和TNF-β的2个SNP位点(rs2009658、rs1041981)在福建泉州地区汉族人群的RA中,同一基因多SNP位点联合作用均呈正相关性。