高质量的审计服务能够提高财务会计信息发挥资产定价和资源配置的作用,同时能够有效降低信息不对称的程度,减轻由逆向选择和道德风险造成的效率损失,是缓解企业代理问题的外部治理机制的重要组成部分。独立审计相关问题也被越来越多的学者关注,而现代审计依赖于内部控制,审计人员是内部控制理论研究的发起者和推动者,也是该理论发展至今最大的使用者。那么内部控制对独立审计具体会是怎样的影响?转轨进程中我国企业面临的制度背景之一是我国巨大的地域、文化、资源等差异造成不同区域计划向市场转轨程度的不均衡,那么在市场化进程差异的情况下,内部控制对独立审计又有何影响?与以往研究不同,本文利用我国2009-2011沪深A股上市公司为样本,采用实证研究方法,研究发现:内部控制质量差的上市公司,越可能选择“非十大”所进行审计,审计费用越高,越可能获得“标准”审计意见,而且地区市场化进程越差,以上研究结论越是显著。本文不仅通过分析上市公司内部控制对独立审计治理机制的影响,深化了对企业内部治理机制的认识,还借鉴制度环境与公司治理机制之间的共生互动理论,考察在我国转轨经济的特定制度背景下,市场化进程与内部控制对独立审计治理机制的联合影响。研究表明,审计治理效应的充分显现,不仅需要有效的内部控制和完善的市场化水平,而且更需要两者的互动与协同。