明珠湖是崇明最大的天然淡水湖泊，原是长江南支的一条支流，上个世纪七十年代经人工筑堤围造而成。从70年代至今，明珠湖的生态系统发生了较大变化，近年来由于崇明经济的发展和明珠湖旅游景点的开放，对明珠湖水域水质状况的影响正逐步扩大，要想实现崇明岛建设现代化生态岛区这一目标，对其水域水质的监测和研究显得尤为重要。许多学者对崇明岛明珠湖水域的鱼类、水生植物生态学和底栖生物生态学等进行了生态学研究。作为湖泊生态系统重要成员的原生动物和轮虫群落结构特征还没有深入研究过。因此，对明珠湖原生动物和轮虫的群落结构特征的调查研究以及对明珠湖水质的监测研究是非常必要的。本文于2007年1月至2009年12月，历时3年，对明珠湖的原生动物和轮虫的群落结构与物种多样性变化进行了研究，并对明珠湖水质进行了生态学评价。以期为生态岛的建设、世博会旅游环境以及评价崇明岛水域环境污染提供基础资料与参考体系，为崇明岛乃至整个上海地区淡水生态系统原生动物、轮虫生态学的深入研究与应用提供基础数据。　　 主要结果如下:　　 1、2007-2009年明珠湖共鉴定原生动物110种，隶属于3纲44属，其中鞭毛纲13属38种、肉足虫纲11属35种、纤毛纲20属37种。共鉴定轮虫62种，隶属于2目8科28属。　　 2、明珠湖原生动物优势种共有21种，其中优势度排前7位的为卵形隐滴虫、二角多甲腰鞭虫、尾眼虫、裸腰鞭虫、膝曲眼虫、游仆虫、片口砂壳虫。明珠湖轮虫优势种共有15种，其中优势度排前7位的为刺簇多肢轮虫、萼花臂尾轮虫、暗小异尾轮虫、盖氏晶囊轮虫、螺形龟甲轮虫、红眼旋轮虫、刺盖异尾轮虫、壶状臂尾轮虫。　　 3、明珠湖原生动物密度均值为141258ind./L，生物量均值为0.879mg/L。轮虫密度均值为12689ind./L，生物量均值为1.157mg/L。明珠湖原生动物和轮虫现存量均存在季节变化，即冬春季较低，夏秋季较高。但站点间变化差异不明显。　　 4、明珠湖原生动物Shannon-Wiener物种多样性指数H周年均值为1.934±0.629；Margalef物种丰富度指数D周年均值为1.204±0.586；Pielou物种均匀度指数J周年均值为0.748±0.146。轮虫Shannon-Wiener物种多样性指数H周年均值为1.325±0.615；Margalef物种丰富度指数D周年均值为0.809±0.553:Pielou物种均匀度指数J周年均值为0.792±0.124。原生动物三种多样性指数均呈逐年上升的趋势；轮虫物种多样性指数、物种丰富度指数呈逐年递增的趋势，而均匀度指数则呈逐年递减的趋势。　　 5、明珠湖原生动物主要功能营养类群以营光合作用的植鞭毛虫种类、吞食藻类为生的肉足虫、纤毛虫和吞食细菌和附有大量细菌的碎屑为生的种类为主，而食肉类群R较少。　　 6、2007-2009年明珠湖轮虫的E/O均值分别为0.38±0.29、1.73±0.98、1.78±1.03；2008年、2009年明珠湖轮虫的QB/T均值分别为1.04±0.52、0.75±0.67。各站点间差异不显著。　　 7、明珠湖原生动物、轮虫现存量与理化因子的相关性为:2007-2009年明珠湖原生动物密度与水温、总氮、总磷、叶绿素a均呈正相关关系；生物量与水温、总氮、总磷呈负相关关系，与叶绿素a呈正相关关系。轮虫密度与水温、溶解氧、pH、总氮、总磷、叶绿素a均呈正相关关系；生物量与水温、溶解氧、pH、叶绿素a呈正相关关系但不显著，与总氮、总磷呈负相关关系但不显著。影响原生动物、轮虫的生态特征分布的主要因子是水温、总氮、总磷、叶绿素a。　　 8、通过理化因子指标、原生动物、轮虫水体污染指示种类以及原生动物、轮虫结构功能参数对明珠湖水质进行生态学评价，得出明珠湖水质总体呈中度污染类型，并呈逐年转好的趋势。