发展生态产业是经济水平到一定程度的必然要求，是实现可持续发展最关键的环节。科学发展观与新型工业化道路的提出，为生态产业发展灌注了新的动力；生态市、生态示范区的建设及循环经济的发展为生态产业研究提供了契机。作为江苏省“两个率先”的先导区与示范区，南京市对生态产业提出了很高的要求，如何实现全市经济与资源环境协调发展，成为本研究需要解决的核心问题。 论文首先综述了生态产业的发展历程，并提出“思想萌芽阶段、理论奠基阶段、应用探索阶段”的三段划分法；简介了与本研究密切相关的六个理论，并指明了在论文中的应用情况；在前人的研究基础之上对工业群落理论作了补充阐述，并首次将建群种学说移植到工业生态学中，提出工业群落建群种的概念，丰富了工业群落生态学理论。 通过理论推导和横向比较，对南京市产业结构、产业发展阶段等作了比较系统的分析和判断，结果表明南京的产业发展已经进入工业化中后期，产业结构正不断地高度化；并对三个规划期内产业发展的阶段分别作了粗放的前瞻分析；立足生态基础支撑条件的角度，提出了南京市发展生态产业的优势和面临的生态问题；给出了发展生态产业的总体思路和目标。 在对全市农业运行状况分析的基础上，提出“三个功能一个方向”的农业定位，即经济功能，生态农产品供应功能、生态服务功能，与都市型生态农业重点发展方向。以农村生态建设与改善为目标，从农业生态布局、生态种植、生态养殖、农业基地建设、耕地保护、生态农业管理等方面出发，抓好农业生产过程中农药、化肥和农用薄膜等生产资料的减量投入和高效利用，以及垃圾、中间废弃物排放和氮磷等营养物的减量输出工作，实现生产过程清洁化，生产产品无害化和优质化，合理开发与保护农业资源，为社会提供生态产品和生态服务；构筑产供销与贸工农一体化的农业生态产业链，将农业与第二、三产业有机整合，建设物质循环系统优化、资源利用高效的生态农业园区，以产业化、规模化带动农业生态化和现代化。在全市工业运行状况分析的基础上，按“点”、“线”、“面”相结合的原则，分别在企业(点)、行业(线)、园区(面)三个层面上对全市工业进行了全面系统的规划和研究，确立了各自的工作方向和主要任务，并提出生态建设的控制指标，以推动工业生态转型。在园区层面，逐个分析了十大园区的生态改造途径，在构筑产业生态链的基础上，发展3—5个将不同企业整合成资源和能源梯级利用、副产品互用的生态工业园区；在行业层面，运用灰色关联度分析和层次分析法，综合考察了经济规模、生态环境要素以及产业关联度，提出全市工业结构的生态调整方向，并重点对电子、汽车、化工、钢铁和电力五大支柱产业的生态转型提出了导向性建议；在企业层面提出了建立在清洁生产和IS014000认证基础上的以循环经济为特征的1000—1500个生态企业创建行动。 在对全市服务业运行状况简单分析的基础上，提出了生态服务业的发展思路和规划目标，确立了“生态旅游、生态校园、生态物流、绿色商场、绿色餐饮、节约型机关”六大生态示范创建工程，并对每个示范工程的主要任务作了规定，希望藉此带动全市服务业生态转型。另外，根据对环境的影响差异，研究提出了将产业划分为生态压迫型、生态友好型、生态改善型三大类的新型划分方法，为采取差异化产业政策、调整优化服务业结构提供依据。