为适应日益膨胀的高等教育需求,我国从90年代末开始实行高等教育大规模扩招的政策,以政府财政支出为主要资金来源的中国高等教育资金需求急剧膨胀。但是,随着我国各项改革的推进,政府面临许多迫切的支出需要,如社会保障体系构建、农村税费改革的政府配套资金、义务教育支出、西部大开发中政府配套资金的支持等,在财政收入并不宽裕的情况下,政府再像原来那样对所有公立高校提供主要的资金支持己不可能,高等教育在政府资金支出序列中已越来越靠后。实行高等教育市场化改革,通过成本补偿机制满足高等教育的资金需求,已经成为我国高等教育发展的必然趋势。政府高等教育支出问题研究是财政理论在高等教育部门的应用,最终目的是为了实现财政资金使用效率与公平的统一。财政收入的缩减和政府其他支出需求迫切性的增强,是世界性的问题。文章首先从公共产品理论视角、公共选择理论视角、人力资本理论视角及高等教育成本分担与补偿理论阐述高等教育财政投入,指出政府是高等教育经费的主要承担者。接着从高等教育财政体制、支出规模、拨款模式等几个方面对我国政府高等教育支出存在的财政性教育经费的预算管理事权和财权不统一、政府对多元化筹措教育资金的政策扶持力度不够、教育经费总体投入不足、现有教育经费使用效率不高、各地区间的高等教育财政支出结构不平衡等问题进行了全面、系统地分析。进而从高等教育投资的方式、途径及投资特点等方面对美国、日本政府高等教育支出政策进行了介绍,并提出了几点经验借鉴。最后,在前面理论分析及外国经验借鉴的基础上,有针对性地提出了完善我国政府高等教育支出的政策建议:规范高等教育财政管理体制;完善高等教育经费投入多元化格局,完善高等教育成本分担机制;改革财政拨款模式,完善财政拨款的评监机制,提高高等教育经费利用率。