东北虎8个微卫星等位基因结构及群体遗传学分析

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野生动物法医鉴定中同一性认定和亲子鉴定常采用微卫星技术。微卫星技术的关键在于分型标准化。虎(Panthera tigris)的微卫星分析已经报道较多,但都没有实现分型的标准化。前期工作中已经验证8个家猫(Felis catus)微卫星位点F85,FCA441,F124,F53,C09,C12,D06和B04均可以用于虎的分析,本文对这8个位点各个等位基因的内部结构进行测序分析,并根据国家法医学会提供的标准进行命名,结果显示,C12和B04的内部结构非常复杂,大小相同的片段可能包含不同的等位基因,建议从亲子鉴定的系统中删除,其余位点均完全可用。此外,我们用这8个位点一个对东北虎种群进行遗传学分析,得到其基因频率、等位基因数(A)、有效基因数(effective allele number,Ne))、观测杂合度(observed heterozygosity, Ho)、期望杂合度(expacted heterozygosity,He)等统计学参数,检测了各个位点与Hardy-Weinberg平衡的符合程度,计算了个体杂合度(MLH)、标准杂合度(SH)等个体质量参数,并用COANCESTRY软件分析个体近交系数。结果显示,种群的遗传多样性水平比较高,且存在近交避免机制,但是未能阻止近交的发生,遗传多样性仍存在丢失的风险,需要采取有效的种群遗传管理措施。
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