都柳江4种鲤科经济鱼类种质资源现状及评价

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鲤(Cyprinus carpio)、鲫(Carassius auratus)、草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、南方白甲鱼(Onychosotoma gerlachi)均隶属鲤形目(Cypriniformes),且均为都柳江重要的经济鱼类。由于都柳江流域人类捕捞活动增强、沿岸工厂建立以及水利工程建设,使鲤、鲫、草鱼和南方白甲鱼种群的生存环境和种群延续遭到不同程度的破坏。目前,仍然缺少关于都柳江该4种鱼类种质资源方面的研究。为此,本研究以该4种鱼类的mtDNA控制区和Cyt b基因为研究对象,运用DNA测序和PCR技术,通过分析mtDNA控制区和Cyt b基因的遗传结构,研究该4种鱼类的种质资源现状,并进行评价,以便为开展都柳江鲤科经济鱼类种质资源的利用与保护提供理论依据。主要研究结果如下:1、本研究获得了都柳江鲤mtDNA控制区序列和Cyt b基因的长度分别为899~901bp和1133bp。结果表明,在mtDNA控制区序列和Cyt b基因碱基组成中,碱基A+T含量高于C+G,4种碱基中以G含量最低。本研究识别了鲤mtDNA D-loop的终止序列区、中央保守区和保守序列区等保守序列。在鲤种群的控制区序列中,共发现24个多态位点,且40尾鲤分属12个单倍型。变异类型包含碱基的转换、颠换、缺失和插入。在都柳江鲤种群Cyt b基因中,共发现了28个多态位点,其中同义突变位点22个,非同义突变位点6个,变异主要分布于密码子第一位点,共定义了15个单倍型,变异为碱基的转换与颠换。都柳江鲤种群mtDNA控制区序列和Cyt b基因的遗传多样性参数显示,都柳江鲤种群遗传多样性较高。2、本研究获得了都柳江鲫mtDNA控制区序列和Cyt b基因的长度分别为787bp和1140bp。在鲫种群的mtDNA控制区和Cyt b基因碱基组成中,A、T含量较高,G含量最低。本研究识别了鲫mtDNA控制区的终止序列区、中央保守区和保守序列区等保守序列。在鲫种群的D-loop序列中,共发现24个多态位点,43尾鲫分属17个单倍型。变异为碱基的转换和颠换,未发现碱基的缺失和插入。在都柳江鲫种群Cyt b基因中,共发现了25个多态位点,其中同义突变位点23个,非同义突变位点2个,并主要分布于密码子第一位点,共定义了10个单倍型,变异类型为碱基转换和颠换,未发现碱基的缺失和插入。都柳江鲫种群mtDNA控制区序列和Cyt b基因的遗传多样性参数显示,都柳江鲫种群遗传多样性较高。3、本研究获得了都柳江草鱼mtDNA控制区序列和Cyt b基因的长度分别为901~905bp和1140bp。在草鱼种群的mtDNA控制区序列和Cyt b基因碱基组成中,A、T含量较高,G含量最低。本研究识别了mtDNA控制区的终止序列区、中央保守区和保守序列区等保守序列。在草鱼种群的mtDNA控制区序列中,共发现11个多态位点,38尾草鱼分属8个单倍型。变异类型包含碱基的转换、颠换、缺失和插入。在都柳江草鱼种群Cyt b基因中,共发现了10个多态位点,其中同义突变位点8个,非同义突变位点2个,并主要分布于密码子第一位点,共定义了8个单倍型。变异类型为碱基的转换和颠换。都柳江草鱼种群mtDNA控制区序列和Cyt b基因遗传多样性参数显示,都柳江草鱼种群遗传多样性较较低。4、本研究获得了都柳江南方白甲鱼mtDNA控制区序列和Cyt b基因的长度分别为686~687bp和1140bp。在南方白甲鱼种群的控制区序列和Cyt b基因碱基组成中,A、T含量较高,G含量最低。本研究识别了南方白甲鱼mtDNA控制区的终止序列区、中央保守区和保守序列区等保守序列,但未识别出CSB-2和CSB-3。在南方白甲鱼种群的mtDNA控制区序列中,共发现11个多态位点,且分属15个单倍型。变异类型包含碱基的转换、颠换、缺失和插入。在都柳江南方白甲鱼种群Cyt b基因中,共发现了3个多态位点,其中同义突变位点2个,非同义突变位点1个,变异位点全部位于密码子第三位,共定义了4个单倍型。变异类型包含碱基的转换和颠换。都柳江南方白甲鱼种群mtDNA控制区序列和Cyt b基因遗传多样性参数显示,都柳江南方白甲鱼种群遗传多样性较低。
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