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为鉴定H9N2亚型禽流感病毒（AIV）感染SPF鸡肺脏脾脏的差异表达蛋白，本研究利用双向电泳（2-DE）结合质谱技术对AIV感染的SPF鸡肺脏蛋白进行初步分析，利用同位素标记相对和绝对定量（iTRAQ）技术结合二维高效液相色谱—电喷雾串联质谱（2D LC-ESI-MS/MS）技术的蛋白质组学方法对H9N2亚型AIV感染的SPF鸡肺脏脾脏蛋白进行检测，鉴定差异蛋白。 为 H9N2亚型禽流感病毒感染SPF鸡肺脏的差异表达蛋白进行初步分析，本实验将30只5周龄SPF鸡分别感染H9N2亚型AIV致病性强毒株AIV A/Chicken/Shandong/818/10(H9N2)和致病性弱毒株AIV A/Chicken/Shandong/196/11(H9N2)，并于感染后24h采集2个感染组和对照组的鸡肺脏，提取肺脏蛋白，对蛋白进行双向电泳分离和质谱检测，结果检测到一个差异蛋白。 为鉴定 H9N2亚型禽流感病毒感染SPF鸡肺脏脾脏的差异表达蛋白，本实验将30只5周龄SPF鸡分别感染H9N2亚型AIV致病性强毒株AIV A/Chicken/Shandong/818/10（H9N2)和致病性弱毒株AIV A/Chicken/Shandong/196/11（H9N2)，并于感染后24 h采集2个感染组和对照组的鸡肺脏、脾脏，提取肺脏和脾脏蛋白，对蛋白进行质谱检测。数据分析结果显示强毒组和弱毒组肺脏组织蛋白与对照组肺脏组织蛋白共同差异蛋白116种，其中Shandong/818/10感染组和Shandong/196/11感染组肺脏组织蛋白较对照组肺脏组织蛋白都上调表达的蛋白有79种，都下调表达的蛋白有37种。致病性强毒组Shandong/818/10感染组和致病性弱毒组Shandong/196/11感染组脾脏组织蛋白与对照组脾脏组织蛋白共同差异蛋白95种，其中强毒组和弱毒组脾脏组织蛋白较对照组脾脏组织蛋白都上调表达的蛋白有70种，都下调表达的蛋白有25种。GO软件注释分析显示差异蛋白参与多种重要的生物学过程，包括代谢、合成、运输、生物调节和免疫反应等。H9N2亚型禽流感致病性强毒株Shandong/818/10和致病性弱毒株Shandong/196/11分别感染SPF鸡后，能引起宿主肺脏组织蛋白表达谱发生不同的改变，本研究结果为进一步研究宿主与病毒相互作用和抗病毒感染的机制奠定了基础。