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后基因组时代主要研究基因的表达产物—蛋白质的表达模式及功能模式，即蛋白质组学研究。蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象的新的研究领域。它旨在阐明生物体内全部蛋白质的表达模式及功能模式，其内容包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰方式)、结构、功能及相互作用等。蛋白质组是指一个基因组所编码的所有蛋白质的总和。蛋白质组方法学包括蛋白质组分离技术和蛋白质组鉴定技术。用于蛋白质分离的双向凝胶电泳技术是蛋白质组研究的核心，而鉴定技术则是蛋白质组技术的支柱。 本文以水稻(oryza sat