工伤认定和劳动仲裁都涉及到劳动关系确认问题,由于两种制度相互独立,并且其涉及到的劳动关系争议、工伤案件的复杂性、耗时性以及法律条文本身的模糊性等因素直接影响到劳动者的合法权益,这对维护我国劳动者的合法权利、维护社会的和谐与稳定构成了威胁。本文结合笔者个人遇到的真实案例,并以此引发的思考,对司法程序中遇到的工伤认定与劳动仲裁制度在涉及确定劳动关系时的冲突加以探讨,分析产生这种冲突以及执法尴尬的立法、程序等原因,提出取消行政部门的工伤认定权,提高仲裁员的选任标准、入行门槛,简化工伤认定程序,赋予仲裁委及司法机关工伤认定权,完善相关法律法规,改进制度运行模式,避免不同部门之间的推诿,减少、避免与本文案例中类似的冲突的发生,减少当事人诉累,保护其合法权益,进而对我国法制化建设产生些许促进。