论文部分内容阅读
目的:
Dicer是一种核糖核酸内切酶,它在siRNA及microRNA的形成过程中起重要作用。我们前期工作发现Dicer将7SL RNA切割成约20至200个以上核苷酸的长度不等的片段。7SL RNA是信号识别颗粒(signal recognition partical,SRP)的组成成分之一。SRP由7SL RNA和6条不同分子量的多肽链结合组成。SRP能够识别并结合刚从游离核糖体上生成的信号肽,且能将与mRNA结合的核糖体带到内质网膜上参与蛋白合成。本课题旨在研究Dicer切割7SL RNA生成的片段对SRP复合体的形成及功能的影响。
方法:
1、过表达Dicer切割7SL RNA生成的小片段产物7SL sRNA5cd,用碱性磷酸酶实验检测7SL sRNA5cd对报告基因分泌型碱性磷酸酶(SEAP)表达的影响;用荧光显微技术检测报告基因融合蛋白ECFP-ER的表达水平;并用流式细胞技术检测细胞表面糖蛋白的表达水平。
2、克隆Di cer切割生成的7SL RNA片段,验证RNA测序的结果。过表达7SL RNA长片段,包括7SL(1-96),7SL(1-212)和7SL(97-299),分别检测其对SEAP的活性、ECFP-ER蛋白表达水平及细胞表面糖蛋白表达水平的影响。在体外将细胞裂解液与7SL RNA片段孵育,通过甘油密度梯度离心技术分离细胞蛋白组分,并用Real time PCR检测全长7SL RNA、用western blot检测SRP亚基在各组分中的相对表达量。
3、在HepG2.2.15和HEK293T细胞中,先用RNAi技术抑制Dicer的表达,然后检测SEAP报告基因、ECFP-ER报告蛋白及细胞表面糖蛋白的表达水平。并在其他细胞系如T29细胞、HCT116细胞和RKO细胞中验证。
4、在下调Dicer的细胞中,转染7SL RNA长片段的混合物,包括7SL(1-96),7SL(1-212)和7SL(97-299),检测SEAP活性、ECFP-ER蛋白表达及细胞表面糖蛋白的表达水平。
5、在下调Dicer的细胞中,用Real time PCR和western blot分别在mRNA和蛋白水平分析Dicer表达降低对SRP亚基表达的影响。
结果:
1、过表达7SL sRNA5cd对SEAP、ECFP-ER蛋白及细胞表面糖蛋白的表达没有显著影响。
2、过表达7SL RNA的长片段[如7SL(1-96),7SL(1-212)和7SL(97-299)]后,SEAP的分泌、ECFP-ER蛋白的表达及细胞表面糖蛋白的表达受到显著抑制。且7SL RNA长片段影响SRP复合物的形成。
3、在HepG2.2.15和HEK293T细胞中抑制Dicer表达后,SEAP分泌显著增加,融合蛋白ECFP-ER和细胞表面糖蛋白的表达也增加。在其他细胞系如T29细胞、HCT116细胞和RKO细胞中得到同样的结果。
4、在Dicer受抑制的细胞中,转染7SLRNA片段的混合物,SEAP的分泌受到部分抑制,ECFP-ER和细胞表面的糖蛋白的表达也得到部分恢复,转染对照LaeZ RNA后没有检测到明显变化。
5、转染siRNA抑制Dicer的表达后,7SL RNA的表达量没有明显变化,SRP亚基在mRNA水平和蛋白水平的表达也没有明显变化。
结论:
1、7SLRNA受Dicer切割衍生的小片段7SL sRNA5cd对SRP介导的蛋白转运没有产生影响。
2、Dicer切割产生的7SLRNA长片段抑制SRP介导的蛋白转运和SRP复合物的形成。
3、抑制Dicer的表达导致SRP介导的蛋白转运增强,且Dicer对SRP介导的蛋白转运的影响不具有细胞特异性。
4、下调Dicer后对SRP功能的影响不是因7SLRNA表达下降引起的,Dicer的抑制也不影响SRP亚基的表达水平。