目的：为保护积石峡库区环境卫生和人群健康,对库区污染源进行消毒和灭鼠处理,分析消毒和灭鼠效果及蓄水对主要传染病流行趋势的影响。方法：对积石峡库区淹没区按照消毒技术方案进行一般污染源和生物污染源的清理,对厕所、畜圈、垃圾堆放地地表进行消毒前后细菌总数和大肠菌群的采样,消毒前后微生物检测数据作统计学处理,细菌总数做t检验、大肠菌群做卡方检验判断各组之间的显著性差异,分析消毒效果；采用鼠夹法调查库区清理前鼠种构成和密度情况,对库区用抗凝血灭鼠药物进行灭鼠,灭鼠前后密度数据作统计学处理,分析灭鼠效果；查阅中国疾病预防控制中心疾病监测信息报告管理系统,分析库区传染病的发病情况和流行趋势；采集捕获鼠类肺标本,冷冻切片荧光染色后用荧光显微镜观察,监测EHF抗原。结果：通过对积石峡库区消毒前后微生物污染调查,库区消毒前平均细菌总数为5.85×106cfu/cm2,消毒后平均细菌总数为2.19×104cfu/cm2,细菌总数的杀灭率为99.63%,经统计学检验消毒前后细菌总数有显著差异,消毒效果明显；库区消毒前大肠菌群阳性数为76份,消毒后大肠菌群阳性数为5份,大肠菌群的杀灭率为93.42%,经统计学检验消毒前后大肠菌群阳性率有显著差异,消毒明显；通过对积石峡水电站库区鼠种调查,为小家鼠优势鼠种。灭鼠前鼠密度为2.95%,灭鼠后鼠密度为0.50%,灭鼠率为88.87%,经统计学检验灭鼠前后密度有显著性差异,灭鼠效果明显；2009年-2011年库区传染病的发病率分别为473.57/10万、382.47/10万、488.38/10万,库区所在地传染病总发病率在水库蓄水前后无明显差别；21份鼠肺标本监测EHF抗原均为阴性结论：此次黄河积石峡库区消毒和灭鼠取得良好效果,首次在青海省报道黄胸鼠；蓄水前后传染病总发病率无明显变化,其中肠道传染病呈逐年下降趋势,血源性及性传播疾病呈逐年上升趋势；库区存在发生鼠疫暴发和流行的风险,发生流行性出血热的危险性很低。