本文根据2006年7～8月（夏季）、2006年12月～2007年2月（冬季）、2007年4～5月（春季）和2007年10～12月（秋季）在长江口及其邻近海域150个站位采集的浮游动物样品，对长江口及其邻近海域浮游动物群落结构和多样性进行了研究。同时，结合同步调查的其他生物、水文和化学资料，研究长江口浮游动物群落对低氧(Hypoxia)区特殊生境的适应及变化，探讨浮游动物水母类、桡足类、端足类、磷虾类和毛颚动物优势类群及关键种对气候变化的响应，力求解释全球气候变暖对浮游动物主要类群数量和分布的影响。研究结果如下：长江口及其邻近海域，四季共鉴定出浮游动物460种，隶属7个门，246属，此外，还有54类浮游幼体。浮游动物群落有水螅水母类(Hydromedusae)，管水母类(Siphonophora)，真水母类(Scyphomedusae)，栉水母类(Ctenophora)，浮游多毛类(Polychaeta)，枝角类(Cladocera)，桡足类(Copepoda)，介形类(Ostracoda)，等足类(Isopoda)，糠虾类(Mysida)，涟虫类(Cumacea)，端足类(Amphipoda)，磷虾类(Euphausiacea)，十足类(Decapoda)，毛颚动物(Chaetognatha)，有尾类(Appendiculata)，海樽类(Thaliacea)，浮游软体动物(Pelagic mollusca)18个类群。在浮游动物群落中，桡足类为最优势类群，水母类、端足类列第二、第三优势类群。浮游动物群落结构和多样性均呈现明显季节变化，浮游动物优势种有明显季节演替现象。浮游动物丰度和生物量有明显时空变化。浮游动物平均丰度夏季最高，达378.1±376.63ind/m~3，冬季最低，仅15.5ind/m~3，春季高于秋季，分别为321.8±535.1ind/m~3和158.7±160.4ind/m~3。浮游动物平均生物量，春季最高，为368±565mg/m~3，冬季最低，为65±120mg/m~3，夏季高于秋季，分别为334±294mg/m~3和180±176mg/m~3。丰度的平面分布特征：春、夏、秋季长江口出现高值区，从近岸往外海丰度逐渐下降；冬季，研究海域丰度分布均匀。生物量的平面分布特征：春、夏季长江口出现高值区，从近岸往外海生物量逐渐下降；秋季，从近岸往外海生物量呈上升趋势；冬季，舟山群岛东侧海域出现高值区，其它海域分布均匀。浮游动物丰度和生物量与叶绿素a和初级生产力的时空变化大体一致。长江口海域桡足类分类学多样性研究表明，桡足类分类多样性指数高低依次为：秋季>冬季>夏季>春季。桡足类多样性指数(H’)秋季出现四季的峰值，冬季最低。显然，桡足类分类多样性指数与传统计算的多样性指数(H’)存在明显差异，但分类多样性指数能更合理解释浮游动物桡足类的物种多样性。Pearson’s相关分析表明，浮游动物主要与盐度、水温、叶绿素a、溶解氧和悬浮颗粒物等相关(P<0.001或0.01)。浮游动物群落结构与环境因子的BIOENV相关分析表明：春季，盐度和悬浮颗粒物是影响浮游动物群落结构的最主要环境因子(Global R=0.821, p<0.01)；夏季，盐度、水深、悬浮颗粒物和pH是影响浮游动物群落结构的最主要环境因子(Global R=0.659, p<0.01)；秋季，盐度是影响浮游动物群落结构的最主要环境因子(Global R=0.815, p<0.01)；冬季，盐度是影响浮游动物群落结构的最主要环境因子(Global R=0.500, p<0.01)。综合Pearson’s和BIOENV相关分析结果，影响长江口海域浮游动物群落结构主要环境因子为盐度、水温、悬浮颗粒物、溶解氧和叶绿素a。浮游动物主要类群研究表明，水母类和磷虾类丰度的季节变化特征为春季>夏季>秋季>冬季。桡足类丰度与浮游动物丰度的季节变化趋势一致，其丰度夏季最高，冬季最低，春季高于秋季，桡足类的种类数量出现上升趋势，强暖水性种针刺拟哲水蚤Paracalanus aculeatus和精致真刺水蚤Euchaeta concinna已成为长江口海域浮游动物优势种，表明暖水种针刺拟哲水蚤和精致真刺水蚤对全球气候变暖的响应。端足类和毛颚动物的种类数和丰度的变化特征为夏季最高，冬季最低，秋季高于春季。长江口海域肥胖软箭虫的丰度和出现频率明显上升，丰度高值区分布往北移动，是肥胖软箭虫对海洋环境变暖的响应。本文首次对长江口外低氧区浮游动物群落结构和多样性进行研究。结果表明：低氧区与邻近海域浮游动物群落结构存在差异，低氧区桡足类物种数明显低于邻近海域。浮游动物的生物量和丰度，低氧区高于邻近海域，主要与低氧区表层浮游植物高现存量和初级生产力有关。夏季，长江口海域浮游动物生物量、丰度、多样性指数、种群丰富度、种类数与底层溶解氧均呈显著负相关关系。