丹参SmCYP76AK2和SmCYP76AK3基因克隆及功能研究

来源 :陕西师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fulingshu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)为唇形科(Labiatae)鼠尾草属(Salvia)多年生草本植物,传统中药以其干燥根茎入药,具有活血化瘀、养血安神等功效。丹参酮类化合物(Tanshinone)是丹参中重要的药用活性成分之一。植物细胞色素P450(Cytochrome P450,CYP450)是广泛存在于植物体内的一类酶蛋白超家族,在植物代谢过程中发挥着重要的作用。近年来,发掘CYP450基因功能已成为了解丹参酮类化合物合成下游途径的研究热点,多项研究聚焦于丹参中CYP450基因参与丹参酮生物合成的方式和途径。本课题结合以往的报道,以丹参全基因组数据库为基础,检索并鉴定获得了 116条丹参CYP450超家族全长基因。通过生物信息学软件分析丹参CYP450超家族成员的理化性质和系统进化关系,将研究范围锁定至丹参CYP76家族;对比不同类型基因的保守基序,分析SmCYP76家族成员的基因结构和9条SmCYP76基因在不同部位及不同激素处理下的表达模式,筛选出了两条SmCYP450基因SmCYP76AK2和SmCYP76AK3,推测其有可能参与了丹参酮类化合物的合成。随后,通过构建两个基因的过表达和敲除载体,利用农杆菌浸染丹参叶片获得转基因株系,验证了目的基因对丹参酮类化合物合成的影响。同时构建目的基因的原核表达载体,诱导并纯化得到目的蛋白,为在体外深入探求两条基因的功能提供了参考。主要研究方法及结果如下:1.参与丹参酮合成目的基因的筛选基于文献查阅和生物信息学分析鉴定获得了 1 16条SmCYP450s全长基因,使用邻接法分别对A-type和non-A-type基因构建系统进化树,发现有67个SmCYP450s(57.8%)属于A-type,归属于17个家族;其余49条基因(42.2%)属于non-A-type,归属于31个家族。利用生物信息学软件对所有成员进行理化性质和保守基序分析,发现不同类型SmCYP450的保守基序有所不同。其中,SmCYP76家族已有3条基因被证实参与丹参酮类化合物合成,且所有SmCYP76基因序列高度保守,存在特有的基序motif 15,推测可能还存在与此相关的SmCYP76。结合该家族成员不同组织部位、不同非生物胁迫的表达模式和响应情况,进一步筛选出了两条可能参与丹参酮类化合物合成和积累的基因SmCYP76AK2和SmCYP76AK3,这两条基因主要在根中表达,并显著响应茉莉酸甲酯和水杨酸等非生物胁迫。2.SmCYP76AK2和SmCYP76AK3转基因株系的获取克隆两条丹参CYP450酶基因SmCYP76AK2和SmCYP76AK3(以下简称SmCYP76AK2/3),两条基因的 cDNA 全长分别为 1548 bp(SmCYP76AK2)和 1638 bp(SmCYP76AK3),分别编码495和491个氨基酸。借助Gateway技术和CRISPR/Cas9技术构建了SmCYP76AK2/3过表达和敲除载体,利用农杆菌介导的叶盘转化法获得了SmCYP76AK2和SmCYP76AK3的过表达和敲除株系,包括3个SmCYP76AK2 过表达株系(OE-AK2-1,OE-AK2-2,OE-AK2-4),7个SmCYP76AK3过表达株系(OE-AK3-1,OE-AK3-2~OE-AK3-7),8个SmCYP76AK2基因敲除株系(CH-AK2-1,CH-AK2-2,CH-AK2-4,CH-AK2-6~CH-AK2-10)和 14 个SmCYP76AK3基因敲除株系(CH-AK3-2~CH-AK3-4,CH-AK3-6~CH-AK3-13,CH-AK3-16,CH-AK3-18,CH-AK3-20)。3.SmCYP76AK2和SmCYP76AK3基因对丹参酮类化合物合成的影响利用LC-MS测定了转基因过表达和敲除植株中丹参酮ⅡA、丹参酮Ⅰ、隐丹参酮、二氢丹参酮和丹参酮ⅡB的含量,结果显示,与对照组相比,SmCYP76AK2过表达植株中丹参酮Ⅰ的含量提高5.49、4.91和4.28倍;隐丹参酮含量提高了 27.76、16.67和25.88倍;丹参酮ⅡB含量提高了 23.21、4.07和4.96倍;二氢丹参酮含量提高了 36.85、28.74和10.50倍;丹参酮ⅡA的含量提高了 44.58、16.67和25.88倍。SmCYP76AK2和SmCYP76AK3的基因敲除植株中各丹参酮类化合物的含量则相对降低超过90%,表明SmCYP76AK2和SmCYP76AK3参与了丹参酮类化合物的合成。4.SmCYP76AK2和SmCYP76AK3蛋白的体外纯化构建SrnCYP76AK2和SmCYP76AK3蛋白原核表达载体,成功诱导表达并纯化出目的蛋白。通过对原核表达载体的诱导表达和对蛋白的纯化,证明SmCYP76AK2和SmCYP76AK3蛋白为可溶性蛋白,诱导温度为16℃时两种蛋白均大量组装,且会产生少量包涵体。综上所述,本研究在探索丹参CYP450超家族系统进化及分类的基础上,对不同组织部位、不同非生物胁迫下基因的表达模式和响应情况进行分析,发现SmCYP76AK2和SmCYP76AK3可能参与了丹参酮类化合物的合成,进一步通过对转基因过表达和敲除株系的研究,证实SmCYP76AK2和SmCYP76AK3参与了丹参酮类化合物的合成,为深入探究丹参CYP450基因调控丹参酮类化合物合成的分子机制提供了参考。
其他文献
学位
近年来,缺血性脑卒中的发病率升高并呈现年轻化的趋势,成为最具威胁人类健康的疾病之一。本课题针对缺血性脑卒中开展基于中药活性成份的药理学研究,我们前期研究结果发现,羟基红花黄色素A(Hydroxysafflor yellow A,HSYA)在8mg/kg、16mg/kg浓度下对脑缺血损伤有较好治疗效果,但在16mg/kg剂量下不良反应多,4mg/kg剂量下疗效不明显。因此,我们结合临床上红花或远志的
蛋白质组学的高速发展为发现癌症生物标志物带来了广阔的前景。本研究基于质谱数据的高维度和稀疏性,利用数据挖掘技术搭建了一套完整的蛋白质生物标志物发现工作流程——PBMiner。该流程由四大模块组成:数据预处理、特征筛选、分类模型构建以及分类模型评估,最终筛选出特定的生物标志物组合。我们将PBMiner应用于弥漫大B细胞淋巴瘤质谱数据,确定了由六个蛋白(PALD1、TBC1D4、TNFAIP8、CMA
中华蜜蜂作为我国当家蜂种,已适应国内多种地区的气候环境及蜜源植物,又因其优秀的抗病虫害能力,加上良好的低温耐受性和利用零星蜜源能力强等优点,成为国内蜂业发展上的重要一员。在工蜂采蜜产蜜和哺育幼虫等行为中,唾液腺是起到关键作用的一类外分泌腺。本研究在比较出房蜂、哺育蜂和外勤蜂这三个发育阶段的中华蜜蜂工蜂唾液腺结构差异的基础上,采用转录组测序的方法对其在不同发育阶段中的基因表达差异进行了研究,旨在补充
学位
在社会主义市场经济下,煤炭企业进入市场当中,和过去国家给予大量补贴的时代不同,现在国家给予的补贴越来越弱,同时受到其他多重因素的影响,煤炭企业的成本越来越高,同时还存在着成本管理失去控制的现象。这些问题给煤炭企业提出了新的要求,下面是笔者结果自身工作经验分析的降低煤炭企业成本的具体措施,为相关的煤炭企业提供合理性参考和借鉴。
党参(Codonopsis pilosula(Franch.)Nannf.)为桔梗科党参属多年生草本植物,以其干燥根入药,具有生津止渴、健脾益肺的功效。目前对党参的研究多集中于其药理作用或成分提取,分子生物学方面的研究较为有限,基因组更未见报道。糖基化是一类存在于所有活体生物中的重要修饰反应,涉及了包括激素稳态的调节,参与植物的防御反应、脱毒反应以及次生代谢产物的生物合成和储存等功能。在植物中,这
阿尔兹海默症(Alzheimer’s Disease,AD)作为一种神经退行性疾病,是导致老年人痴呆的最常见的原因之一,但其发病的分子机制仍不清楚。越来越多的证据表明,无论是在患者还是动物模型中,大脑免疫反应都参与了AD的进展。早老素PS1和PS2条件性双敲除(PS cDKO)小鼠模型除了表现出类似于AD患者中典型的神经退行性病理表型,包括从2月龄就开始表现出随龄恶化的记忆损伤,还在脑中出现大量的
学位
学位