民营中小企业是国民经济发展和社会进步的重要力量,在促进经济平稳较快发展、增加就业、保障和改善人民生活水平等方面做出了巨大贡献。促进中民营小企业又好又快发展,是改善民生、建设社会主义现代化的前提。内部审计制度作为管理的关键要素,可以有效地对内部控制执行再控制,在企业管理中起到了其他部门不可替代的作用。然而,现有内部审计相关法律法规体系不完善、企业自身的问题等因素,导致民营中小企业内部审计在运用过程中面临着许多障碍和挑战,内部审计职能的发挥受到了严重制约,阻碍了企业长远发展。怎样正视其中的问题并予以解决,将关乎到企业在激烈的市场竞争中能否健康可持续发展。本文在总结前人优秀研究成果的基础上,对现阶段内部审计相关理论知识进行梳理,然后以云南省中小企业发展状况为研究案例,总结近几年云南省民营中小企业的运行状况,以当前全国内部审计发展状况为比较分析剖析民营中小企业内部审计运行中存在的实际问题,进而针对具体问题尝试性地提出几点完善内部审计的建议。本文以理论阐述、分析现状问题、提出措施为行文顺序,以云南民营中小企业的内部审计为研究对象,希望能够给民营中小企业的实际工作以一定的实践和理论上的帮助,为我国经济可持续发展提供绵薄之力。