一并多指(趾)家系致病基因突变筛查及突变蛋白转录激活活性的分析

来源 :沈阳医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:donny_zhu
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的并多指(趾)畸形(Synpolydactyly,SPD)是一种常染色体显性遗传性肢体畸形,临床表现为远端肢体异常,其特征是在于手指分离的不完全,并且在趾骨中存在多余的手指。SPD是婴幼儿最常见的手足畸形疾病,其发病率高,但其治疗方法只能通过外科手术的形式恢复其部分的表观功能,无法完全达到正常的生理功能。尽管SPD通过外科手术方式来治疗,随着手术技术及微创技术也在不断的更新进步,但是手术治疗还是一定程度上无法解决到恢复正常的生理功能。这不仅给患者及家人的身心健康造成重大影响,而且对患者家庭和社会均造成重大的经济负担。因此,深入研究SPD的分子生物学领域及致病机制,为临床上提供新的治疗方向及产前诊断的方法均具有其特殊的,深远的重要意义。在研究SPD的分子学致病机制中,我们之前的研究仅仅局限在HOXD13蛋白位于C’端的同源盒结构域内及其附近或位于N’端多聚丙氨酸链内或其附近的突变。并且已经证明了该病的表型与HOXD13基因的同源盒结构域或多聚丙氨酸链的突变有关。但我们在一中国SPD的2代家系中筛查出一个突变位点,该致病的突变位点HOXD13(A22S),该突变位点既不在同源盒结构域内或其附近,又不在多聚丙氨酸链内或其附近,是在先前已知的致病结构功能域之外的新的致病位点,并且该突变位点的位置功能是迄今为止尚未鉴定的,并除了HOXD13同源盒结构域外及多聚丙氨酸链以外的功能域。方法本家系患者于沈阳医学院附属中心医院临床诊断为并多指(趾)畸形疾病,畸形表型及体格检查符合并多指(趾)畸形的临床特征,对能追溯到的家系成员进行详细的身体检查及家族史询问,绘制家系图,同时签署知情同意书。抽取家系成员外周全血提取全基因组DNA,以HOXD13基因为候选致病基因,通过PCR扩增该基因2个外显子及外显子/内含子交界,PCR产物送测序,筛查出基因突变。通过UCSC网站(http://genome.ucsc.edu)分析碱基改变所对应的氨基酸位点在不同物种之间序列的保守性分析,再通过预测软件采用I-TASSER自动穿线法预测分析这种蛋白质的一级结构改变对蛋白质三级结构空间构象的影响。以野生型质粒pcDNA3.1-HA-HOXD13WT为模板,采用PCR反应扩增含突变位点的HOXD13基因全长,后在进行定点突变,构建突变型质粒,送检测序。通过蛋白质免疫印记(Western Blot)实验检测HOXD13A22S突变型与野生型蛋白质在体外细胞内表达:将HOXD13MUT、HOXD13WT、pcDNA3.1-HA、HOXD13Q50R质粒分别通过瞬时转染的方式,转染到HEK293细胞后培养48h,再提取细胞内总蛋白,后进行SDS-PAGE垂直板电泳,转膜,选取特异性抗体进行免疫印记。通过双荧光素酶报告基因实验检测HOXD13A22S突变对其转录活性能力的影响:将HOXD13MUT、HOXD13WT、pcDNA3.1-HA、HOXD13Q50R质粒内含有萤火虫和海肾的荧光素酶报告基因质粒,通过瞬时转染的方式分别转染到HEK293细胞后培养24h,再进行双荧光素酶报告基因的活性检测。结果本家系患者(II1)为女性,5岁,主诉先天性右足5趾多指,无骨性滑膜病和皮肤蹼。患儿父亲(I1)为左足4、5趾并趾。家系其余成员未发现类似临床症状和相关其他的足部疾病,临床诊断为并多指(趾)畸形。对该SPD家系的表型和基因型分析,并参考数据库文献结果该家系遗传方式为常染色体显性遗传。PCR扩增该HOXD13基因的2个外显子及外显子/内含子交界区后,送检测序,结果发现该患者HOXD13基因第1外显子存在一个杂合性突变位点(c.64G>T),导致第22位氨基酸发生错义突变,由非极性丙氨酸突变为极性丝氨酸(p.A22S)。通过UCSC网站上分析:该碱基改变所对应的氨基酸位点在不同物种之间的序列存在高度的保守性;通过自动穿线法I-TASSER预测分析提示:突变前后HOXD13蛋白构象发生变化,野生型HOXD13蛋白第22位丙氨酸参与形成α-螺旋,而在突变后的第22位丝氨酸却参与形成β-转角。构建出突变型真核表达载体pcDNA3.1-HA-HOXD13A22S测序结果正确。Western Blot实验证明三种质粒HOXD13WT、HOXD13MUT、HOXD13Q50R蛋白质均在体外细胞内表达。双荧光素酶报告基因的实验数据结果采用T检验的方式分析HOXD13WT、HOXD13MUT、HOXD13Q50R组间差异,结果表明:显著性水平为P>0.05,统计学无显著差异,没有统计学意义。结论1.该家系为常染色体显性遗传病:并多指(趾)家系(SPD1),突变位点为2号染色体HOXD13基因第1外显子发生杂合性错义突变(c.64G>T)。2.生物信息软件分析提示该突变所在的氨基酸位点在不同物种间的高度保守性,并且该突变使蛋白质的一级结构改变进而影响了该蛋白质的空间构象,可能导致蛋白质的功能发生变化。3.HOXD13A22S突变体对EphA7启动子转录激活能力没有影响。
其他文献
基于2005—2012年西北地区51个市(州/地)的面板数据,利用相关指标测度了西北地区城市化进程对产业结构演变的驱动效应,在对其时空演化基本趋势把握的基础之上。利用空间自相关检验
档案管理是高校管理的重要组成部分。档案是记录着高校在长期发展过程中基建、教学、科研、管理等活动的重要文件,对高校的发展来说具有重要意义。本文首先分析了高校档案管
肺癌是发病率和死亡率增长最快的恶性肿瘤之一,严重威胁人类健康。基于中医药治疗的药物治疗是中国肿瘤治疗领域的一大特色,川贝母作为传统的止咳化痰类中药材,近年来研究发
同学们,你们见过这幅画吧?在哪儿见过的?能说说这幅图画的所表现的内容吗?
“带彩打牌”作为一种社会文化现象流传已久,在Y市这一风气尤甚。近年来,伴随着Y市经济发展,带彩打牌之风盛行。部分党员、干部及普通民众痴迷于带彩打牌,成为阻碍Y市社会发展的一个棘手的社会问题。为了全面落实中央、F省及Y市市委关于改进工作作风、从严管理干部的要求,整治党员干部以及民众“带彩打牌”之风,Y市出台了移风易俗整治带彩打牌的文件,开展了专项治理行动。通过选取F省Y市的部分城市社区与乡村为研究单
选择何种股权激励模式来提高上市公司绩效一直是这几年来的热门话题,尤其是近几年来,资本市场的环境与条件逐步成熟,在中国实施限制性股票和股票期权激励的上市公司数量不断
石库门是上海的标至性建筑之一,也是近代上海居民的主要生存空间,它见证了上海近代一百多年的发展历程,成为上海独有的建筑文化遗产。石库门建筑有规律的排列形成了弄堂,上海
多基因系统发育研究方法是系统发育分析中的一个重要手段,基因树冲突已成为分子系统发育研究中日益突出的问题。烯醇化酶基因(eno)及其编码的蛋白广泛存在于五界系统中,烯醇化
“迎神!仪式官各司其事!”在司仪底气十足的高声祷告中,一场精彩纷呈的祭祀先农的活动正在先农坛隆重举行。只见数十名衣着华丽的舞蹈演员和技艺高超的乐师有条不紊地忙碌着,神情肃穆的清朝“皇帝”率领文武百官毕恭毕敬地完成了迎神、初献、亚献、终献、撤馔、送神等礼仪活动。现场仪式庄严肃穆,引来众多的北京市民和来自各地的游客驻足观看。整个祭祀活动长达两个多小时,完美再现了清代皇帝祭祀先农的场景。  据了解,每年
小时候我就喜欢手表,看别人戴手表可羡慕了.第一次看到人家戴手表是1961年夏,我上小学五年级.下午放学了,我们走在从良善庄村到下西市村的路上.一对年轻夫妇从岔道也走到这条