小型底栖动物（meiofauna）是许多经济鱼、虾和贝类幼体阶段的优质饵料,是底栖食物网中重要的一环,小型底栖动物对于环境的变化较为敏感,使这类生物成为海洋环境质量重要的指示生物。根据沉积物质量评价三元法,底栖群落生态是环境质量评价的重要一环。自由生活海洋线虫作为小型底栖动物的最优势和重要类群,了解各种生境海洋线虫的群落生态特征可以进一步评估各研究海域的环境质量状况。总体上,我国潮间带沙滩、红树林和泥滩中的小型底栖动物本底资料仍较匮乏,各生境海洋线虫发现、鉴定和描述新种的工作仍任重而道远。本论文于2018～2020年在厦门鳄鱼屿、厦门下潭尾人工红树林湿地、大亚湾和广西北海潮间带,包括沙滩、红树林和泥滩3种生境进行了小型底栖动物采集,并测定了温度、盐度、底质粒径、有机碳、有机氮、叶绿素、脱镁叶绿素、重金属和多环芳烃等多种环境因子。结合历史数据,分析了东南沿海潮间带小型底栖动物群落结构,并探讨了与环境因子的关系,较为完整地分析了小型底栖动物群落生态特点,丰富了该区域小型底栖动物数据资料。主要研究结果如下:（1）在沙滩生境,中潮带小型底栖动物密度大于低潮带;季节分布上是春季最高,其次是冬季,秋夏较低;底栖猛水蚤的密度较高。海洋线虫的摄食类型主要是非选择性沉积食性者1B和刮食者2A,即以小颗粒有机物和硅藻为主。海洋线虫 Terschellingia、Paralongicyatholaimus、Dorylaimopsis、Halichoanolaimus、Metachromadora 与 Axonolaimus 是沙质生境常见的优势属。（2）在红树林生境,寡毛类数量较高;海洋线虫的优势摄食类型为非选择性沉积食性者1B,即以腐烂的有机碎屑为食。Terschellingia、Sabatieria、Parodontophora、Spilophorella、Daptonema、Anoplostoma、Viscosia等是东南沿海红树林区中海洋线虫的典型优势属,全球广布属Daptonema有可能对无瓣海桑和白骨壤生境根系分泌物敏感导致在红树林中极少分布。（3）在泥滩生境,小型底栖动物和海洋线虫的密度在春季较高,夏季最低;与红树林相比,寡毛类的数量较少。泥滩中海洋线虫最典型的属是广布属Daptonema和Terschellingia。Sabatieria在下潭尾和大亚湾红树林中均较少分布,在泥滩中均有较高分布。下潭尾和大亚湾海洋线虫优势摄食类型均为非沉积食性者1B。（4）影响潮间带海洋线虫群落结构的最重要环境因子是沉积物中的粒径组成。不同生境优势属中Sabatieria均与粉砂呈显著负相关关系,Terschellingia均与Cr含量呈显著负相关,可能为Cr敏感种。Daptonema、Parodontophora和Steineria可能是耐多环芳烃属。（5）根据有机质、重金属或多环芳烃阈值,所有研究站位的环境质量均属于“高”或“好”等级;根据成熟度指数、C-P值、香农-威纳多样性指数和营养多样性指数阈值,鳄鱼屿秋季和春季部分站位属于“好”,夏季部分站位属于“差”等级。同安湾下潭尾各站位等级变化大。春季大亚湾红树林属于“中等”,大亚湾林缘和泥滩站位属于“差”或“劣”等级。夏季北海红树林和北海沙滩属于“中等”,北海泥滩属于“差”。大部分红树林生境比泥滩环境质量好,四个季节中,夏季的环境质量一般是差的。在生态质量评价中,应该主要考虑成熟度指数、C-P值、香农-威纳多样性指数和成熟度指数这几个生物变量。（6）本论文描述了近三年采自东南沿海潮间带的海洋线虫4新种和1新记录种,名录为:Parasphaerolaimus jintiani Fu,Boucher＆Cai,2017 新种;Sphaerolaimus callisto Zograf,Pavlyuk,Trebukhova＆Nguyen,2020 新记录种;Sabatieria longispicula n.sp.新种;Tripyloides mangrovensis Fu,Zeng,Zhou,Tan＆Cai,2018 新种;Tripyloides amoyanus Fu,Zeng,Zhou,Tan＆Cai,2018新种。我们的研究结果可为潮间带小型底栖动物的研究提供重要的基础数据,也可为全球气候变化背景下潮间带的保护、开发和利用提供科学依据。