生物制药产业作为一门新兴产业，既带来了经济的快速增长，也给环境保护带来了极大压力。与传统的化学制药产业相比，生物制药产业不仅会涉及到许多有毒有害的溶剂、助剂的使用，这些化学物质对环境和人体健康都具有瞬时或潜在累积影响，生物制药产业还会涉及到新的风险问题，即各种病原微生物、生物活性物质和转基因带来的生物安全问题，至今还未为人们所详知。并且，区域开发建设具有规模大、强度高、范围广、不确定因素多、管理层次多等特征，其存在的风险因素对环境的影响要比单一的建设项目复杂得多。因此，为了保障生物制药产业的健康发展，有必要对其环境风险问题进行深入分析，并制定相应的环境风险管理方案。本文根据生物制药产业的产业特征，针对产业涉及的生物安全问题和化学风险分别展开研究和探讨，并以上海市张江高科技园区中的生物医药基地为例，分别在企业层次和区域层次上开展环境风险调查和分析。在此基础上，为张江园区构建全过程环境风险管理体系，提出了包括风险回避措施、规划布局优化和企业风险控制在内的“前端”管理策略，以及“末端”的风险应急预案，实施统一、有序的管理，为实现该区域生物制药产业的健康和可持续发展提供基础保障。