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背景:随着二代测序技术和基因组学的不断发展,人们对乳腺癌的认识已经超越临床现象进入分子生物学层面。研究表明,GATA结合蛋白3(GATA-binding protein 3,GATA3)是乳腺癌中最常见的突变基因之一,其在乳腺癌的发生发展中起关键作用。然而,目前关于中国乳腺癌患者中GATA3的基因突变状况及其与临床病理特征、预后的关系尚不明确。目的:探讨GATA3的突变特征及其与乳腺癌临床病理特征、预后的相关性,为乳腺癌基因诊断层面及个体化精准治疗决策提供临床依据。方法:本研究共纳入就诊于广东省人民医院(Guangdong Provincial People’s Hospital,GDPH)经病理确诊为浸润性乳腺癌、既往未接受治疗的589例中国乳腺癌患者,采用二代测序技术检测原发肿瘤组织中包含GATA3在内的520个癌症相关基因的基因型。并分别纳入国际乳腺癌协会的分子分类数据库(Molecular Taxonomy of Breast Cancer International Consortium,METABRIC)、癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中具有完整临床资料及GATA3突变信息的浸润性乳腺癌患者1981例、960例。采用卡方检验检测GATA3突变与临床病理特征的相关性,并在三组人群之间进行对比分析。以Kaplan-Meier法、COX多因素比例风险模型分析METABRIC、TCGA数据库中GATA3突变与预后的关系。最后,采用KEGG信号通路分析GDPH数据库中GATA3野生型组及突变型组癌症相关基因的突变谱差异。结果:在本中心589例乳腺癌患者中有81例患者发生GATA3突变,共检测出85例突变位点,其突变频率为13.8%(81/589)。90.5%(77/85)的突变集中在羧基末端区域及锌指结构域,突变类型以框移突变、剪切突变为主。本中心数据显示,GATA3突变主要发生于ER阳性(18.4%vs.0.6%,P<0.001)、PR 阳性(18.2%vs.3.8%,P<0.001)、HER2 阴性(17.5%vs.6.3%,P<0.001)、HR+/HER2-亚型(HR+/HER2-20.9%vs.HR+/HER2+9.9%vs.HR-/HER2+0.0%vs.HR-/HER2-1.5%,P<0.001)乳腺癌中,且更倾向于发生在腋窝淋巴结阴性(18.2%vs.10.4%,P=0.007)、低增殖指数(22.6%vs.10.9%,P<0.001)的早期乳腺癌(15.7%vs.6.5%,P=0.009)中。对比西方人群METABRIC、TCGA数据库,GATA3突变频率分别为11.6%(230/1981)、9.7%(93/960),其具有与GDPH数据库相近的热点突变区域及主要突变类型。在METABRIC、TCGA数据库中,GATA3突变同样与ER 阳性、PR阳性、HR+/HER2-乳腺癌密切相关(P值均<0.05)。且TCGA数据显示GATA3在发病年龄小于50岁(13.7%vs.7.9%,P=0.005)、绝经前(16.2%vs.7.1%,P<0.001)患者中更容易发生突变。对METABRIC、TCGA数据库患者行COX多因素分析,结果提示在METABRIC数据库中GATA3突变可能是乳腺癌的一个独立的良好预后因素,GATA3突变患者具有更优的总生存(HR=0.587;95%CI 0.428-0.806;P=0.001)。此外,KEGG通路分析结果显示,与GATA3野生型组相比,GATA3突变型组在细胞周期(21.2%vs.37.9%,P=0.036)的变异频率显著较低。结论:中国乳腺癌人群与西方乳腺癌人群在GATA3突变频率、突变位点、突变类型上具有相似的突变谱。GATA3突变与乳腺癌预后良好的临床病理特征密切相关,提示携带GATA3突变患者可能具有更优的预后。