反式7,8-二羟-9,10-环氧苯并(a)芘诱发细胞应答反应的剂量效应和时间效应的蛋白质组学研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gyl720909
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
苯并(a)芘(BaP)属于多环芳烃类(PAHs)环境化学污染物,主要由煤、烟草和其它一些有机化合物高温加热或燃烧不完全时产生。苯并(a)芘在体内经微粒体酶代谢活化后生成终致癌物7,8-二羟-9,10-环氧苯并(a)芘(benzo(a)pyrene-7,8-dihydrodiol-9,10-epoxide,BPDE),其中反式-BPDE是代谢产物中活性最强的,具有亲电性碳原子活性基团,能与组成核酸的碱基和组成蛋白质的氨基酸的亲核基团共价结合形成加合物,损伤生物大分子的结构和功能,从而引发核苷酸切除修复,DNA跨损伤复制,细胞周期“校正点”等信号通路的激活,以及基因表达的改变。BPDE是一个全致癌物,两阶段致癌实验表明它既是致癌剂又是促癌剂。其中,BPDE在癌变发生启动期的机制已经得到了广泛研究,主要是导致DNA突变形成:BPDE第10位上的C与DNA鸟嘌呤的N~2位形成加合物(+)-trans-anti-BPDE-N~2-dG,它们将阻断DNA复制,通过细胞的DNA合成机构的旁路合成途径,即跨损伤DNA合成(translesion DNA synthesis,TLS),细胞可以避免这些未经修复的损伤对细胞的致死性影响,但在损伤碱基的对面常插入错配的碱基,通常是G→T的碱基颠换突变,导致细胞面临基因突变的风险。与BPDE的致突变机制广泛研究相反的是,BPDE诱发的细胞早期反应中是如何影响信号转导通路从而激活转录因子和它们的靶基因表达所知甚少。现在的研究发现BPDE作用后p53,PI-3K/Akt/JNKs,MAPKs/AP-1,IKKbeta/NF-kappaB等信号通路被激活。为了研究BPDE对基因表达的直接影响,用DNA免疫沉淀技术鉴定并克隆BPDE结合的DNA片段,总共得到67个基因片段。这些片段经测序并与GenBank数据库BLAST之后,发现其功能包括DNA修复,凋亡相关,锌指蛋白,酶,表达序列标签克隆,CpG岛。这些数据进一步说明BPDE与相关基因DNA直接结合也是诱导基因表达变化的一个重要机制。与此同时,高通量的基因芯片技术也被用于检测BPDE暴露后,细胞中基因发生的全局变化和涉及的信号通路。Akerman等用含有350个人类基因的芯片发现BPDE处理后改变的基因涉及:细胞周期调控,谷胱甘肽解毒,细胞凋亡等等。在毒理学研究中,我们通常要考虑细胞或动物暴露于环境污染物后的剂量反应关系。但是,用能诱导非毒性、亚毒性或毒性反应的不同浓度的外来污染物作用后,有时候不一定能得到良好的剂量依赖关系,甚至于能诱导机体产生完全不同的反应。Moller等人的研究结果发现用低、中、高三个浓度道诺红菌素(daunorubicin)处理细胞后,差异蛋白质组显示道诺红菌素能导致20个蛋白的表达水平在三个浓度都上调,大部分不具有剂量依赖关系。除了暴露剂量,暴露后的时间间隔也是一个需要考虑在内的重要因素。随着暴露后时间的延长,可以发现与时间相关毒性反应的可观察的基因或蛋白表达改变,有助于了解早期反应和晚期反应的作用机制和寻找相关的生物标记物。我们实验室曾用苯并[a]芘处理细胞,引起广泛的蛋白表达改变,其中以锌指蛋白和一些参与转录调控的蛋白多见。为了消除苯并[a]芘的代谢转化效率差异的影响,我们随后采用苯并[a]芘的代谢终产物BPDE进行深入研究,用低浓度0.005μM BPDE处理FL细胞,在细胞外液中发现有3个出现的蛋白点,16个表达上调的蛋白点。为了更好的了解细胞反应的全貌,实验中还用不同的暴露剂量以期获得更多的信息来阐明细胞对BPDE的应答机制。应用基因芯片技术分别检测0.005μM、0.05μM、0.5μMBPDE暴露后基因表达的改变并用实时定量RT-PCR进行验证,发现在低浓度0.005μM和0.05μM浓度组发生改变的基因较少,而高浓度0.5μM发生改变的基因数目较多,这些基因的功能涉及细胞周期调节、信号转导、转录因子、代谢有关的酶等。可能涉及的信号通路包括:p53,MAPK,Akt/PKB。刘更等发现用低浓度0.005μM和0.05μM BPDE可以诱导内质网应激反应(endoplasmic reticulum stress,ER stress),但较高浓度0.5μM BPDE未见类似变化。以上这些实验结果使我们迫切想揭示不同浓度BPDE暴露和暴露后不同时间细胞发生的变化。近年来,生物技术的飞速发展使得更全面广泛的了解这种变化成为可能。许多高通量技术如cDNA芯片,实时RT—PCR,以及生物信息学已被用于细胞应激反应,实验结果令人鼓舞。但是这些技术都不能提供转录后的尤其是蛋白质在翻译后修饰的信息,而蛋白质通常是细胞内的功能执行者。以双向电泳(2-DE)作为分离技术和质谱作为鉴定技术的蛋白质组学的方法能同时分离细胞内几千个蛋白,并能研究翻译后修饰以及蛋白的相互作用,因此在相关领域中受到广泛的应用。因此,在本研究中,应用双向电泳和基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF)相结合的蛋白质组学方法来筛选不同浓度BPDE暴露和暴露后不同时间哺乳动物细胞的差异表达蛋白,研究可能存在的差异表达蛋白与BPDE浓度、作用时间的关系,找寻对BPDE有特异反应的蛋白。通过生物信息学方法对差异蛋白进行分类,探讨不同功能蛋白对BPDE的响应可能对细胞产生的毒性影响。我们用BPDE处理FL细胞,二甲基亚砜作为溶剂对照组,然后提取细胞总蛋白。采用24cm,pH 4-7的IPG胶条及同时可跑12块胶的Ettan DALTⅡ垂直电泳系统进行分离,银染的胶经数字化成像和图象分析后发现:量效关系中有65个蛋白斑点在BPDE处理后12小时发生了显著的变化。其中有1个斑点在0.05μM和0.5μM BPDE处理后的细胞中检测到,1个斑点仅在0.5μM BPDE处理后的细胞中检测到;另外有24个蛋白斑点在0.005μM BPDE处理后表达量发生改变(11个上调,13个下调),24个蛋白斑点在0.05μM BPDE处理后表达量发生改变(16个上调,8个下调),25个蛋白斑点在0.5μM BPDE处理后表达量发生改变(14个上调,11个下调),有10个蛋白斑点在两个处理剂量组都发生了改变,没有蛋白斑点在三个剂量组都发生改变。进一步的,我们切取胶上的差异蛋白斑点,然后用特异性的胰酶消化,酶解后的肽段用基质辅助的激光解吸离子化-飞行时间质谱(MALDI-TOF)鉴定,得到各个蛋白的肽质指纹图谱(peptide mass fingerprinting,PMF)。根据肽质指纹图,在网上用MASCOT搜索软件分别搜寻NCBI的非冗余蛋白序列数据库(nrNCBI),46个蛋白质得到了鉴定。这些得到成功鉴定的蛋白质功能涉及面非常广,包括转录调控,细胞周期,细胞增殖,信号转导,细胞骨架,发育,代谢以及其他功能未明的等等。表明BPDE对细胞产生了广泛的影响。在时效研究中发现用0.05μMBPDE处理后3小时,12小时和24小时,一共有128个蛋白斑点的表达发生了改变。36个蛋白斑点在0.05μM BPDE处理后3小时表达量发生改变(11个上调,25个下调),29个蛋白斑点在0.05μM BPDE处理后12小时表达量发生改变(20个上调,9个下调),69个蛋白斑点在0.05μMBPDE处理后24小时表达量发生改变(35个上调,34个下调),有6个蛋白斑点在两个处理时间点都发生了改变,没有蛋白点在三个处理时间点都发生改变。其中84个斑点得到了成功鉴定。与量效研究相似的是,时效研究中这些得到成功鉴定的蛋白质功能涉及面也非常广,几乎涵盖了量效中改变蛋白的各个类别。结论:BPDE作用后细胞内发生了广泛的变化,有众多蛋白参与了应答反应,这些蛋白涉及到细胞的不同功能,为进一步研究BPDE与机体交互作用的分子机制提供了线索,并为寻找人群接触环境致癌物后的生物标记物提供可能。研究未发现蛋白有剂量依赖关系和时间依赖关系,说明不同浓度BPDE暴露及暴露后不同时间细胞应答反应机制是不一样的,高浓度BPDE作用后,细胞应答反应体系不是低浓度作用后的简单放大,存在更为复杂的致毒机制,不同浓度BPDE暴露及暴露后不同时间,可能激活细胞内不同的途径来产生毒性效应。
其他文献
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
通过测土配方施肥技术肥料效应田间试验,获得最佳施肥量和施肥比例,建立了花生施用氮、磷、钾的三元二次效应方程,提出达到最高产量或最大经济效益的施肥量,为花生配方施肥指标体
二硫化碳(Carbon disulfide, CS2)是一种应用广泛的有机溶剂,主要用于橡胶的硫化、谷物蒸熏、石蜡、石油的精炼以及粘胶纤维的制造等。CS2为多系统毒物,其对神经系统、心血管
中学生物理竞赛能够激发学生学习物理的兴趣和主动性,探讨学生的学习方法,从而提高其学习能力。本文研究如何在物理竞赛大纲的基础上建立物理学体系,选择竞赛教程并合理制定
铁蛋白是广泛存在于生物体细胞中的一类铁贮藏蛋白,具有调节铁代谢平衡以及去除亚铁离子毒性的双重功能。与动物铁蛋白相比,关于植物铁蛋白的结构和功能的研究甚少。目前已发
回 回 产卜爹仇贱回——回 日E回。”。回祖 一回“。回干 肉果幻中 N_。NH lP7-ewwe--一”$ MN。W;- __._——————》 砧叫]们羽 制作:陈恬’#陈川个美食 Back to yield
建设部副部长叶如棠最近强调要增强城市设计观念。他说,城市设计有很多理论,最重要的一条是要以人为中心,特别是在以汽车交通为主的发达国家,为市民提供最大的方便和安全是城
在利用伏安法测电阻的实验中,若不知道被测电阻的大约值,一般采用试触法.如图1所示,连接电路时,只空出电压表的一个接头S,将S分别与a,b接触,观察电压表和电流表的示数变化情况.若电压
本文应用方块脉冲函数,导出了计算二次型性能指标下的积分微分方程所描述的确定系统的最优控制和最优轨线的直接算法。而且求出了最优反馈控制。
花生新品种“彩色珍珠”是湖南农业大学采用辐射诱变技术选育而成。其突出特点:一是外观和食味品质优异,果形美观,种衣色彩鲜艳,出仁率高,食味香甜而酥松;二是油酸与亚油酸比值(O/L)达