农村信用社作为我国农村金融的重要组成部分,成立以来,经历了多次变革,在不同时期不断调整其在社会主义市场经济中的形态,以适应社会发展,在支持农民生产、生活,振兴乡村建设方面起到了极其重要的作用。农村信用社较其他金融机构有其特殊性,我国四大国有银行,以及其他金融机构都是先有总行,再有分支行,因此,可以严格按照母子公司的治理模式进行治理,农村信用社为自下而上组建,先有乡镇信用社,再由县级联社统一法人,随后由县级联社出资组建市级、省级联社,而组建后的省、市联社在高管任免、薪酬制度、经营管理等方面反过来对县级联社享有领导权,资本上先有父后有子,管理上先有子后有父。省联社的定位也一直是省政府的派出机构,省联社一直按照“国企”来管理,高管由省政府任命,然而,农村信用社并没有国有资本成分;农村信用社营业执照上,性质是“集体所有制”,然而,从股本金结构来看,已经没有了“集体”的股份,股权与管理、企业性质不相匹配。农村信用社的历次改革均更注重对其组织形式的界定,而对其管理体制基本没有很好地探讨,管理上的混乱导致了一系列问题,农村信用社在高速发展的同时,也出现了不良贷款居高不下、监管指标不断恶化、案件风险频发等问题。改制组建农商行,再次成为了农村信用社的热词和大势所趋,目前农村信用社改制组建农商行已经进入关键时期。本文结合云南省农村信用社及其县级信用社改革实际,从信用社法律定位、股权结构、管理体制、法人治理结构等方面进行分析,探讨改制后的农商行合理进行法律性质定位、明晰产权结构、进行管理体制改革、优化法人治理结构的重要性,最终完善商业银行体制,激发农商行活力,促进农商行发展。